SCENIC转录因子分析结果的解读 / 开普饭

2021 年 1 月,Nature 将空间转录组学评为 2020 年 "年度技术",业内很多人士都认为,空间转录组学是解读基因表达的下一个前沿技术. 波士顿儿童医院的助理教授 Je ...

基因转录的过程当中,基因由DNA转录成mRNA的过程受到很多因素的调控.其中就包括了转录因子的调控.转录因子调控的一个主要的过程是转录因子和基因启动子区进行结合进而来对其表达进行调控.由于每个转录因子 ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

Single-cell RNA sequencing of immune cells in gastric cancer patients 针对胃癌患者免疫细胞的单细胞测序一. 研究背景免疫检查点 ...

去年我们在<生信技能树>公众号带领大家一起学习过:SCENIC转录因子分析结果的解读 ,提到了在做单细胞转录因子分析,首选的工具就是SCENIC流程,其工作流程两次发表在nature系列杂 ...

一.转录因子介绍转录因子(Transcription factors)是一群能与基因特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子.转录因子通过识别特定的DNA序 ...

前面我们已经是完整的展示了使用R语言的scenic做转录因子分析的流程,但是在公开课演示100个细胞走这个流程,发现居然是耗时20min,实在是不能忍.哪怕是再不喜欢python,也得学一学pysce ...

本来是想测试一下,使用pyscenic做转录因子分析,然后记录笔记给大家!所以就有了昨天的:使用pyscenic做转录因子分析,但实际上我在里面埋下了一个伏笔,就是使用conda安装的这个pyscen ...

希望所有学员都可以站在生信技能树的舞台上发光发热! 下面是粉丝随机投稿文献解读: 小鼠内皮细胞的单细胞转录图谱摘要各种组织中上皮细胞(Endothelial cells, EC) 的异质性依然没 ...

一.什么是探索因子分析探索因子分析主要用于对问卷数据进行统计分析. 通常我们在做问卷分析的时候,如果我们设计的题项没有明确的维度划分,而我们又需要了解这些题项的维度,这时我们就需要对这题项进行探索因 ...

小燕子论文:Transcription-independent Induction of ERBB1 through Hypoxia-inducible Factor 2A Provides Car ...

论文:Comprehensive analysis of translation from overexpressed circular RNAs reveals pervasive translat ...

SCENIC转录因子分析结果的解读