单细胞初探（seurat基础流程）（2021公开课配套笔记） / 开普饭

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

Single cell RNA-seq analysis workshop 1 Quality Control 大家好,我是晨曦,本次将开启一个全新的系列,依旧是单细胞,依旧是熟悉的晨曦解读,只不过这 ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉法国图卢兹癌症研究中心学者Jean-Jacques Fourniéa等人于2019年5月22日在<PNAS>上发表题目为<Single-cell ...

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

简介Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析.Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型的单细胞数据的函数.目前Seur ...

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

摘自:xuzhougeng https://www.jianshu.com/p/cf7a7341b0b6 目前该软件只支持Mouse和Human,不支持其他物种,因此不是这两个物种的小伙伴可以不用看了 ...

与传统的转录组测序相比,单细胞测序技术噪声很大,使得单细胞转录组数据包含大量的dropout事件(导致基因表达量为0或接近0),即使是一些标记(Marker)基因也有可能表达量很低.当在使用其对聚类的 ...

新课发布在B站了,马上有热心的粉丝看完后写了配套笔记: 下面是粉丝linbo的笔记投稿依旧seurat 官方教程为例 rm(list = ls()) library(Seurat) library( ...

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小荷的编织花园2021公开课: 春夏款套头衫"芷洁" 授课时间:初定于3月20号左右教课方式:直播+课后指导需要线材:8号蕾丝线6-7两需要钩针:可乐钩针1.25mm

今天聊一聊十天干,天干地支是讲时间的,在奇门遁甲中天干甲是遁起来的,在奇门盘中围一圈的八个方格,每个方格内最少都有两个天干,分别是天盘干跟地盘干,方格之外还有一个天干,那个叫做引干,有些方格内有三个天 ...

在奇门遁甲中八门代表了人事,这次讲八门中的休门,八门是指休门.生门.伤门.杜门.景门.死门.惊门.开门,它们按照八卦的顺时针排列依次被放置在奇门遁甲的人盘.门为福祸之柄,门就好像人的嘴和鼻子,嘴和鼻子 ...

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单细胞初探（seurat基础流程）（2021公开课配套笔记）