多个探针对应同一个基因取最大值的代码进化历史 / 开普饭

# 3. id转换 ----------------------------------------------------------------- ##方法一:使用R包转换 index = gse ...

之前有很多人问我们,有时候没有DataSet full SOFT file文件,只有图二的界面,该怎么办呢? 我们可以下载Series Matrix File(s),然后进行分析但是这样得到的仅有p ...

这个需求实在是太常见了,很多时候我们下载的表达矩阵,都是基因的探针ID作为行名来标记,如下: 这个变量是 dat,一个表达矩阵, 所以需要对探针进行注释,并且筛选. 首先看看注释的结果: 很明显可以看 ...

前些天我发现了乳腺癌领域的PAM50算法原理探索,在:PAM50的概念及分子分型算法原理 ,其实并不难,然后我注意到他们在挑选50个基因的时候,提到了多个探针对应同一个基因到底该如何取舍原文是:F ...

这么简单的问题,总是有人问,而且总是有人不搜索就到处问,本来我是很生气的,后来想一想,应该是我们没有教会大家搜索,也不能全部怪新手. 以前我都是建议大家取最大表达值探针来作为基因的表达量,其实最大值也 ...

内容提要:本文首先为大家分享了两个excel取最大值函数的实际行业案例,然后用讲故事的方式为大家总结excel最大值函数max.large的使用. excel最大值函数常见的有两个,分别是Max函数和 ...

我们都知道不同的物种在进化过程中其实共享很多基因的,尤其是哺乳动物,同一个基因虽然在不同的物种序列不完全一样,位于的染色体也不一样,发挥的功能可能也稍微有点区别,但是他们的相似性非常高!根据相似性就可 ...

使用bioconductor注释包如果该芯片平台有对应的bioconductor注释包,只有约90个常用的芯片有! 比如: library(hgu133a.db) ids=toTable(hgu13 ...

第一次是:TCGA的28篇教程-风险因子关联图-一个价值1000但是迟到的答案第二次是:(重磅!价值一千元的R代码送给你)芯片探针序列的基因组注释其中第二个教程是纯粹的R代码技巧,怕粉丝看不懂,我 ...

最近在答疑群里收到一个很经典的提问,就是: 请问各位老师,GPL570芯片中应该有部分基因是LncRNA,能否通过基因重注释的方式把有意义的LncRNA筛选出来呢?R语言能否实现呢? 而且学生特别的好 ...

多个探针对应同一个基因取最大值的代码进化历史