​cytoscape的十大插件之四--BiNGO插件

(0)

相关推荐

  • 使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析(有参情况)

    寻找差异表达的基因并识别它们的功能,是我们进行RNA测序的最主要目的.很明显,这些差异的基因必然与功能改变密切相关,例如,比较患病个体与正常个体的组织表达谱,不难想到这些显著失调的基因参与了生物学过程 ...

  • GO、KEGG富集分析(一)有参情况

    一.GO分析的理论知识 what is Gene Ontology(GO)? 基因'本体论' Gene Ontology中最基本的概念是 term.GO里面的每一个entry都有一个唯一的数字标记,形 ...

  • 手把手教你使用Cytoscape的这两个插件

    一.BiNGO的使用 1.数据准备(自己筛选的差异基因) 2.安装插件 3.安装好插件后,就打开插件 4.粘贴差异基因 5.选择相应的参数 6.给GO富集分析起一个名字,然后点击Start BiNGO ...

  • 用Metascape进行一站式的蛋白功能富集和PPI网络分析

    通过组学测序得到一组基因或蛋白后,对着测序报告中给的热图火山图,很多新手都是很困惑的.对于这些结果,我们还能做些什么,才能对我们的后续研究工作提供真实可靠的提示与帮助呢?能否得知这些基因主要参与了哪些 ...

  • 新手教程 | 非模式物种GO/KEGG注释!使用 EggNOG-mapper 快速完成~

    前段时间,毕业转医学的师弟和我讨论了一些基因集合功能富集分析的项目.对于非模式生物来说,麻烦的不仅仅是富集分析,更在于"注释",如Gene Ontology注释和KEGG注释.聊到 ...

  • ​cytoscape的十大插件之--cytoHubba插件

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧!见:生信必备技能--Cytoscape 下面是cytoscape讲师的笔记 一.软件下载 cytos ...

  • ​cytoscape的十大插件之二--MCODE插件

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧!见:生信必备技能--Cytoscape 下面是cytoscape讲师的笔记 一.MCODE插件 关于 ...

  • 关闭 ​cytoscape的十大插件之之三--stringApp

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧!见:生信必备技能--Cytoscape 下面是cytoscape讲师的笔记 一.stringApp插 ...

  • ​cytoscape的十大插件之五--Centiscape(计算多个中心值)

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记 一. ...

  • ​cytoscape的十大插件之六-GENEMANIA

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记 一. ...

  • ​cytoscape的十大插件之七CytoCluster

    五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦. 下面是cytoscape讲师的笔记 如今,生物网络的聚类分析已成为识别功能模块以及 ...

  • 十大连环杀手之四:拥有众多女粉丝的查尔斯·曼森

    2017年11月19日,美国连环杀手查尔斯·曼森在医院自然死亡,终年83岁,曼森不但是臭名昭著的杀人狂魔,邪教组织"曼森家族"的领导人,也可以说是人类社会中魔鬼的化身. 不过,有一 ...

  • 2018年度世界航运业界十大女性之四:克里斯汀·霍尔斯/挪威银行DNB︱阿法牛

    2018年度世界航运业界十大女性之四: 克里斯汀·霍尔斯/挪威银行DNB 阿法牛AlphaBull 上海海事大学 曹颖 编译 [前言]2011年,劳氏日报的年度<航运业界影响力人物100人> ...

  • 隔离原理:防呆法十大原理之四

    隔离原理:分隔不同区域的方式,来达到保获某些地区,使其不能造成危险或错误的现象发生. 比如民用建筑中的屋面爬梯,依据相关要求,要有一定的高度或者采取上锁等措施,预防无知的小孩由于好奇攀爬. 生产现场的 ...