8种方法可视化你的单细胞基因集打分 / 开普饭

与传统的转录组测序相比,单细胞测序技术噪声很大,使得单细胞转录组数据包含大量的dropout事件(导致基因表达量为0或接近0),即使是一些标记(Marker)基因也有可能表达量很低.当在使用其对聚类的 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

简介Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析.Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型的单细胞数据的函数.目前Seur ...

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

Single cell RNA-seq analysis workshop 1 Quality Control 大家好,我是晨曦,本次将开启一个全新的系列,依旧是单细胞,依旧是熟悉的晨曦解读,只不过这 ...

前两天介绍了一个开发中的单细胞数据分析相关R包,内置了,4(热图,气泡图,upset图,堆叠条形图)+4(密度散点图,半小提琴,山峦图,密度热图)美图,见 8种方法可视化你的单细胞基因集打分 ,蛮多小 ...

光合效率低下限制了作物生产的生产力和可持续性,以及农业对未来社会和环境挑战的适应力.Rubisco是改善的关键目标,因为它在光合作用的碳固定过程中起着核心作用,并且效率很低.将叶绿体编码的Rubisc ...

在Excel中,可视化数据的方法是很灵活多样的.既可以使用传统的图表,也可以利用图表和其他元素的结合.在以前的文章中,我介绍过很多类似的案例.今天介绍的合格方法,我们不使用图表,也不使用条件格式,而是 ...

血液(血清游离DNA)基因检测是否准确涉及关键的三个问题:转移类型.检测时机.运气,还有一个硬件问题是检测水准,近些年检测技术在逐步提升,而且这是非病情的相关因素,只需要选择技术过硬的医院.大公司或者 ...

在社保中,大家除了关注医保外,对养老金的关注度也很高,毕竟养老金是很多退休老人的主要生活来源. 我们都知道,只有当退休时缴纳了至少15年社保,才能拿到养老金.根据不同地区的不同规定,需要缴纳15年.2 ...

在美学角度而言,书法是一种视觉造形艺术,讲究变化与造势.下面,我们总结书法10种变化,悟懂和实践这些变化,越写越清爽.越有味! 大小变化三个同样大小的字,笔划的粗细与多少差不多的,若相连在一起 ...

对于我们所有人来说,疫情是不确定的时期,现金流量很少的小型企业主尤其感到紧缩.为了帮助你确定如何在诸如冠状病毒等危机时期管理业务,我们与世界领先的管理专家进行沟通,以下是一些要点,Azides博士为你 ...

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