学徒第一步：飞一般的SRA数据下载法 / 开普饭

[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...

导言前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...

本期和大家分享糯米饭在使用SRA Toolkit下载NCBI-SRA原始数据的一些Tips,时间宝贵,直接上干货. 1.明确Project:SRP119720,打开浏览器,输入: https://w ...

如何高效又简单地省时地获得SRA公共数据的Fastq格式数据陈胖子下载NCBI SRA数据库上的公共数据,整体上还是大部分搞数据分析,又想灌水的人必做的一个事情. 其实直接使用官网推荐的工具asp ...

当我们需要一些NGS数据时,一般会去NCBI或者EBI的数据库中下载.但是当我们用wget下载时,时常会出现断开连接或者网络下载速度缓慢,对于几十G或者上百G的数据,下载无计可施,这是则可以使用Asp ...

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

前几日因任务关系需要在数据库中找一些关于胃癌临床样本的芯片数据,在耗费几滴珍视明后,竟被我找到一个非常不错的数据集.这个数据集(GSE27342)的样本来源于80名胃癌患者,并分别对肿瘤组织和瘤旁组织 ...

今年以来,南通市认真贯彻落实中央"迈好第一步.见到新气象"要求,围绕勇当全省"争当表率.争做示范.走在前列"排头兵,坚持稳中求进工作总基调,巩固拓展疫 ...

LA PIÑA MARIANA [点击左下角阅读原文即可下载无水印配方] 复活蛋里有乾坤,这个可爱的蛋糕来自EPCB的才女chef Saray Ruiz(下图),看着貌似比较复杂,其实操作很简单,主要 ...

Photo by Corinne Kutz on Unsplash 在网络上兼职写作赚钱,是一个门槛低,但很有前景的副业方法. 利用业余时间,靠在网络上写文章,每月赚几千到一万甚至更多的,大有人在. ...

采编:Melody 文红燕也没想到,三年前因为强台风"天鸽"侵袭中国澳门后研发的一个手机应用程序,会在2020年初爆发的疫情中发挥如此重要的作用. "之前我们都说不需要. ...

Tushare简介 Tushare是一个免费开源的python财经数据接口包,主要能够实现对股票.期货等金融数据从数据采集.清洗加工到数据存储的过程,能够为金融分析人员提供快速.整洁和多样的便于分析的 ...

通过第一步对双汇发展财报关键数据的计算分析和第二步对双汇发展的企业分析,我们知道双汇发展是值得关注和投资的好公司. 今天,第三步,双汇发展企业估值和好价格的计算,看看双汇现在的价格是不是值得入手的好价 ...

学徒第一步：飞一般的SRA数据下载法