TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGAToolbox包获取TCGA数据
相关推荐
-
数据库数据 | TCGA数据库33种癌症的 transcriptome profiling (RNA-Seq) 数据
该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年7月12日 下载方式:TCGAbiolinks包 数据类型:RData 变量名称:expDataTPM > ##加载数据,数据对象是一个数据 ...
-
maftools : 总结、分析、可视化
转自:程凉皮儿:https://www.jianshu.com/p/7b02459defedmaftools_2clp02 June, 2020maftools : 总结.分析.可视化 MAF文件ma ...
-
[汇编资源]肿瘤相关数据库资源汇编合集
欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. Cancer-related Data Resources A ...
-
肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER 2.0数据库真心好用!
解螺旋公众号·陪伴你科研的第2542天 肿瘤免疫分析神器 肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素.由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞 ...
-
lncRNASNP: LncRNA相关SNP突变数据库
lncRNA中的SNP及其对lncRNA的影响怎么做?疾病中lncRNA的表达是什么? 这样的小问题,LncRNASNP大可爱都能解决. lncRNASNP的构建图 IncRNASNP 是提供人.小鼠 ...
-
TCGA数据库MAF文件的分析以及可视化(maftools包的使用)
这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...
-
TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据
前些天被TCGA的终结新闻刷屏,但是一直比较忙,还没来得及仔细研读,但是笔记本躺着的一些TCGA教程快发霉了,借此契机好好整理一下吧,预计二十篇左右的笔记 --jimmy 往期目录如下: 使用R语言的 ...
-
使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据
前些天被TCGA的终结新闻刷屏,但是一直比较忙,还没来得及仔细研读,但是笔记本躺着的一些TCGA教程快发霉了,借此契机好好整理一下吧,预计二十篇左右的笔记 --jimmy 第一篇目录 TCGA数据源 ...
-
生信小技巧第8课,加上 TCGA的28篇教程- 批量下载TCGA所有数据
长期更新列表: 视频讲解-R爬取生信软件列表到思维导图 生信技巧第3课-请你务必学好R语言 broad官网出品的 必须神器 IGV 资料大全,含视频 生信技巧第5课-生信人必须安装的软件 好神奇啊,两 ...
-
TCGA的28篇教程- 数据下载就到此为止吧
长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...
-
TCGA的28篇教程- 指定癌症查看感兴趣基因的表达量
m长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的 ...
-
TCGA的28篇教程- 对TCGA数据库的任意癌症中任意基因做生存分析
长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...
-
TCGA的28篇教程-整理GDC下载的xml格式的临床资料
长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...
-
TCGA的28篇教程-风险因子关联图-一个价值1000但是迟到的答案
早在 2017-03-13 我就在生信技能树推出过绘图交易专区: [有偿专区]TCGA 预后作图 那个时候隐隐约约知道这是一个很大的市场,可惜人的精力是有限的, 我需要持续更新 10000+ 生物信息 ...
-
TCGA的28篇教程-数据挖掘三板斧之ceRNA
长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...
