NGS数据分析实践：05. 测序数据的基本质控 [2]

咱们<生信技能树>的B站有一个ChIP-seq数据分析实战视频课程,缺乏配套笔记.恰好前些天的求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,走大运结识了几位优秀小伙伴! 其中中国医科大 ...

近些年来,随着生物信息分析方法的发展,MinION测序reads成功比对参考基因组的比例已经从66%提升至92%.文章下面对各种工具的适用场景进行了分别介绍.工具概述见表1. (1)碱基识别工具 Me ...

对原始测序fq文件数据进行质量控制任务了解fastq测序数据需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量! 作业,理解测 ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

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前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库,而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列,免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类,以及TCR的TRA,TRB, ...

NGS数据分析实践:05. 测序数据的基本质控 [1] - FastQC 目录前言 1. FastQC 1.1 帮助信息及运行代码 1.2 报告解读 1.3 小结文接上篇:NGS数据分析实践:04 ...

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

文/海艳上市IT公司经营计划专业经理,专注消费电子领域经营分析以财务报表分析为例,我会围绕这五种不同的方法论,逐步阐述他们在 PowerBI 中的应用,整体架构如下图所示: (点击查看大图) 之前 ...

变异识别过程可以分成3大块:1. 原始数据质控:2. 数据预处理:3. 变异识别.大致可以细分为6个部分:(1) 原始测序数据的质控:(2) read比对,排序和标记PCR重复序列:(3) Indel ...

NGS数据分析实践:02. 参考基因组及注释库的下载 - 目录 1. 参考基因组数据 2. 已知的SNP和Indel变异数据 3. annovar注释所需数据库的下载 4. 其他数据库系列文章: 二 ...

系列文章: 二代测序方法:DNA测序之靶向重测序 NGS数据分析实践:00. 变异识别的基本流程 NGS数据分析实践:01. Conda环境配置及软件安装 NGS数据分析实践:02. 参考基因组及注释 ...

翻译: 大邓作者: Bex T 标题: Weekly Awesome Tricks And Best Practices From Kaggle 链接: https://towardsdev.com ...

NGS数据分析实践：05. 测序数据的基本质控 [2] - MultiQC