【直播】我的基因组79：为什么这些基因的覆盖度如此之低？ / 开普饭

引言前面两期主要为各位简单介绍了转录组测序以及转录组测序的方法,相信各位对转录组测序有了一定的了解.那么测序后进行数据分析,具体包含哪些分析内容呢?本文就详细为各位介绍一下. 分析内容 mRNA是具 ...

写在前面高通量测序技术普及,大量物种基因组被测序.组装质量逐步提高,但基因结构注释的质量则一如既往的让人担心.错误的基因结构注释,可能会使得你得到错误的结果.比如: 不准确的基因结构注释,使得编码蛋 ...

二代测序基础知识二代测序基础概念 (这个是与二代测序相关每个部门都要掌握的) FQ数据格式高通量测序(如Illumina HiSeqTM/MiseqTM)得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识 ...

写在前面这大半个月我都在医院待着,确实无法做太多事情,于是选择看一些文献.选择的是目前开发最完善,且可以说是在IGV-GSAme[之前我改造的IGV版本]出现之前的唯一一款基因结构注释人工矫正软件- ...

前面我们已经详细讲解过如何根据窗口来统计每条染色体的每个片段的GC含量,还有平均测序深度,请大家自行前往前面查看脚本及实现方式![直播]我的基因组47:测序深度和GC含量的关系那么如果得到了如下的数 ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

这个需求比较少见,主要是因为有很多朋友都做了基因检测芯片数据,而芯片检测的结果只有4列,分别是dbSNP数据库ID号,染色体,坐标,还有基因型.如下: head -100 wegene.txt |ta ...

相关运算在视觉目标跟踪算法中发挥了重要作用.在跟踪过程中,相关运算通过简单的相似性比较,来完成模板和搜索区域特征的交互,输出一张相似度图来确定目标的位置.然而,相关运算本身是一个局部的线性匹配,导致了 ...

文:刘步尘惠而浦中国的新营销探索已获业界认同,在2021中国家电创新零售峰会上,凭借在企业数字化转型和新零售方面的创新实践,惠而浦中国折桂"2021中国家电创新零售先锋品牌奖"及 ...

基因组区间文件一般是拷贝数变异记录文件或者peaks文件,一般的注释是基于基因的,因为目前大家对编码蛋白的基因是比较熟悉的,一个区域跟基因关联起来了就大概了解它的功能了. 首先得到需要注释的bed文件 ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较.可以添加多种图展信息,如热图.散点图等. 本文目标: 可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮.可 ...

导读蛋白质是人体的基本功能单位,也是从基因组到表型信息传递的关键媒介.蛋白质可导致多种疾病的发生发展,因此也是目前药物最常见的作用靶标.已有研究结果表明,通过对蛋白质数量性状基因座(pQTLs)的临 ...

【直播】我的基因组79：为什么这些基因的覆盖度如此之低？