趣事 | 基因结构注释人工矫正软件-Apollo的开发历史 / 开普饭

美国麻省理工学院的科学家在11日出版的<自然·通讯>杂志撰文称,在进行了广泛的比较基因组学研究之后,他们绘制出了新冠病毒迄今最精确完整的基因注释图谱,确认了几种蛋白质编码基因,也发现有些基 ...

下载IGV和导入文件的方法我就不多说了,可以直接在windows平台下使用,就跟你操作QQ一样,自己摸索就好了! 著名芬兰运动员Eero Mäntyranta,他拿过七枚奥运奖牌.他的血红细胞远超正常 ...

写在前面课题组目前做一些基因组相关工作.了解基因组的朋友应该明白,基因结构注释错误几乎遍布所有基因组,包括我们目前看到的大多数即使是发表在顶级期刊的工作.生物是复杂的,而算法是存在局限的.所以人工矫 ...

IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor,简称IGV-GSAme 写在前面 igv是目前最常用的本地基因组浏览器,与其开发的目标类似,用于整合各种类别的高 ...

有良心的科研,都是应该做出哪怕是一点点的贡献.反感任何人只是鼓励别人发文章灌水. 写在前面半个月前,我推了一个<任何人都能掌握-基因家族分析>的腾讯课程(原本事实是开给课题组).在热身课 ...

写在前面很久很久以前,我就已经写过 GFF3/GTF 注释信息的部分提取功能.每一个GXF文件,往往包含的两万个左右基因(数万个转录本)的外显子,CDS等信息.而我们一般感兴趣的,常常只是其中的一些 ...

写在前面目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码,大量物种的基因组序列被测定和释放.与此同时,对应的基因结构注释信息文件,如GTF或GFF3文件等,也可公开下载. 对于绝 ...

高通量数据下载还能这样操作? 谁能告诉我,这数据测毁了么? 目的: 在UCSC下载hg19参考基因组,我博客有详细说明,从gencode数据库下载基因注释文件,并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构, ...

============================================ 写在前面:可以参考另外一篇<得到差异基因后怎么做?> ====================== ...

植物基因组结构变异(Structural variations, SVs)包括基因插入/缺失变异和拷贝数变异,与单核苷酸多态性和表观遗传差异一起构成种内和种间可遗传表型的多样性.了解SVs在植物表型变 ...

基因结构预测中同源注释策略,将mRNA.cDNA.蛋白.EST等序列比对到组装的基因组中,在文章中通常使用以下比对软件: tblastn gamp exonerate blat 根据我的实测,以上软件 ...

趣事 | 基因结构注释人工矫正软件-Apollo的开发历史