LncRNA分析流程搭建——前言 / 开普饭

做教学我们是认真的,如果你对我们的马拉松授课(直播一个月互动教学)有疑问,可以看完我们从2000多个提问互动交流里面精选的200个问答! 与十万人一起学生信,你值得拥有下面的学习班: 生信入门课-20 ...

图:<高通量测序与高性能测序-理论和实验>封面在生物信息学领域,高通量测序+高性能计算已经成为主要的解决方案.北京市计算中心作为多年致力于该领域,并以数据分析为主要优势的一线机构,经过多 ...

长链非编码RNA(lncRNA)是一类新型调控分子,它在从胚胎发育到肿瘤发生等在多种生理病理过程中发挥重要调控作用.虽然人类lncRNA发现数量和规模快速扩张,但这些工具仅支持从单一角度对长非编码RN ...

转录组测序背景简介狭义的转录组默认只包含mRNA,但是广义的转录组指的是细胞或组织中所有转录产物的集合,其中包含mRNA和非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA).非编码RNA目前 ...

lncRNA是长链非编码RNA(Long non-coding RNA)的简称,其长度大于200个核苷酸,在表观遗传调控.细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,已经成为了当今遗传学研 ...

转录组测序简介「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , pi ...

长链非编码RNA(long non-coding RNA)是一类长度大于200bp,不编码蛋白的RNA,广泛存在于生物体内.lncRNA测序可选择采用去除rRNA或DSN真核生物全转录组建库的方法进行 ...

虽然我一直讲解的GEO数据挖掘,都是基于mRNA这样的表达芯片,但实际上miRNA,lncRNA,甚至circRNA芯片也是大同小异的分析流程. 所以,如果你确实是第一次接触circRNA芯片数据,完 ...

在整个七月和八月份总共发表了在线数据库61个.这里我们基于前面两期的分类,主要汇总成了五个方面:疾病相关数据库,DNA相关数据库,RNA相关数据库,蛋白相关数据库,流程化数据库以及其他方面的数据库.由 ...

软件支持的分析类型众多,那么如何快速建立自己需要的呢?首先我们还是要从大框架上对分析做一个简单的分类,如此挑选的时候更容易做到心中有数.分类有许多的角度,这里将ANSYS结构分析简单分为如下几个类别: ...

本节我们介绍Nextflow中的Combine Operators类型.Combine-operators-合并操作符合并操作符包含以下类型:joincrosscollectFilecombineco ...

本节我们介绍Nextflow中的Splitting operator类型.Splitting operators-分割操作符分割操作符用于将channel中的元素分割成不同的块儿,这些块结构将会下游的 ...

本节我们介绍Nextflow中Transforming operators类型.Transforming operators-转换操作符转换操作符包括buffer, collate, collect, ...

本节我们介绍Nextflow中的Operator类型,Operator用户连接不同的Channel或者按照用户指定的规则进行数据的变换操作. Operators分为以下7种类型: Filtering ...

本节我们介绍Nextflow中的Channel类型,Channel是nextflow中process之间进行数据传递的通道. Channel主要有两个属性: 采用异步操作的方式进行数据传递: 数据接收 ...

在前面的两节内容中我们介绍了Nextflow的安装和流程监控平台Nextflow Tower, 大家如果对软件安装还有疑问可以查阅平台中前面两节的内容.这里我们以nextflow的一个具体运行脚本来进 ...

在第一节中,我们介绍了nextflow的平台支持和安装方法,这一节我们将介绍流程监控的利器nextflow tower. 相信之前自己搭建过生信流程的小伙伴对流程监控的重要性都非常清楚,俗话说:&qu ...

像经常处理生物信息大数据的同学,肯定有自己一套的分析脚本,也就是常说的pipeline了.在我刚开始的时候,也是按照大伙的分析流程,一步一个脚本,后来熟悉了一些,会把经常用到的脚本放在一起,再用变量名 ...

LncRNA分析流程搭建——前言