【直播】我的基因组27-先简单统计一下全基因组变异情况吧 / 开普饭

系列文章: 二代测序方法:DNA测序之靶向重测序 NGS数据分析实践:00. 变异识别的基本流程 NGS数据分析实践:01. Conda环境配置及软件安装 NGS数据分析实践:02. 参考基因组及注释 ...

变异检测得到的结果是检测样本的基因组序列与参考基因组序列之间的差异.本质上是一个将真实的变异从文库准备.样本富集.检测/测序和映射/比对产生的产物中分离出来的过程.想要进一步研究每一个变异的实际意义, ...

前面我们扯到bam文件的各种操作,vcf文件的各种操作,基础知识不牢固的同学可能已经云里雾里了.这次我们来讲一个简单的.就是拿到了fastq的测序数据,如何把全基因组分析给跑一遍.(不谈细节!) 首先 ...

好久不见,我们的直播又开始啦!今天,我们主要讲的是人群分布,先用简单的PCA来分析一下千人基因组的人群分布吧! PCA分析,就是主成分分析,我博客有讲过(点击最底部的阅读原文或复制链接http://w ...

上一讲中,我们对蛋白的编码基因的测序深度和覆盖度进行了统计,其中有的覆盖度很高,有的覆盖度却又很低,针对这个统计出的测序深度及覆盖度,我们就可以做一些简单的统计及分析. 首先,可以看看覆盖度为10%~ ...

万一您身边的朋友用得着呢? 截止今日小菜已分享300+篇经验之谈,可以文章编号或关键词进行搜索以下才是今天的正式内容-- 郑重声明:本文仅为传递更多信息,绝无广告嫌疑,网络使用存在泄露信息等诸多风险 ...

等级资料怎么分析呢? 采用卡方还是秩和检验? 临床上评价疗效时,很多时候测定的疗效数据类型是等级资料. 比如,中医领域最喜欢用的就是"临床治愈.显效.有效.无效". 慢病与康复领域 ...

推荐:江舜尧编译:罗睺编辑:马莉美国纽约西奈山伊坎医学院精神病学.神经科学.遗传学和基因组科学学系Joseph Buxbaum与美国哥伦比亚大学生物统计学系 Iuliana Ionita-Laz ...

番茄(solanum lycopersicum)是一种很有价值的果树,产量是番茄最重要的农艺性状之一.然而,番茄产量相关性状的遗传结构尚未完全阐明.基于∼从605份不同材料中获得440万个单核苷酸多态 ...

抖音直播回放大家好!我是S2755的战姬. 本期战姬的抖音直播话题:公会管理.新区号活动规划发展.关于15/16星. 错过或者来晚了的小伙伴请看下面的回放以及要点总结. 1.公会公会作为这个游戏版 ...

【直播】 我的基因组27-先简单统计一下全基因组变异情况吧