【直播】我的基因组78：简单解析一下蛋白编码基因的测序深度及覆盖度 / 开普饭

透过专利信息跟踪农业生物技术最新研究成果--2021年第24周篇作者:莱肯生物很多技术和产品的创新由于各种原因无法或暂时无法发表研究论文(高影响因子论文和高价值专利评判标准的不同.保持新颖性的需要 ...

写在前面前述,我做了笔记之一.该些内容在高铁上完成学习.回家之后,至今12天,抽空我完成了剩余所有课程的学习,并做笔记之二.这主要在于记录我个人认为值得我记录的知识,而并不是为了给读者学习. 整体上 ...

推荐:江舜尧编译:杨雅媛编辑:马莉福建省水产研究所海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室黄种持团队于2019年7月20日在<Moclecular Ecology Resources>发 ...

编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读谷氧还蛋白(GRX)是广泛存在的氧化还原酶,参与多种细胞过程,在氧化应激反应机制中起关键作用.本研究旨在探讨GRX的结构-功能关系, ...

二代测序基础知识二代测序基础概念 (这个是与二代测序相关每个部门都要掌握的) FQ数据格式高通量测序(如Illumina HiSeqTM/MiseqTM)得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识 ...

UBE3A基因,英文全称为Ubiquitin Protein Ligase E3A,中文名称为泛素蛋白连接酶E3A,该基因编码的UBE3A蛋白是泛素蛋白降解系统的一员.该印迹基因在大脑中以母源染色体表 ...

目前我使用的仍然是hg19系统的参考基因组,所以就在gencode数据库里面下载了基于hg19的gtf注释文件,并格式化如下: head ~/reference/gtf/gencode/protein ...

看来本次直播我的基因组分析流程效果还不错,不少朋友跟着自己动手开始分析全基因组测试数据了,值得表扬.其中有好几个朋友留言向我反映公司给的统计报告里面的覆盖度的问题,如下图: 我在第 8讲中写道,每条染 ...

在这之前我们已经对VCF格式记录的变异文件有了初步了解,那么接下来我们就实战一下,凭自己的理解来对VCF文件中的内容做一个简单的统计. 我们提到过VCF文件的第八列是比较复杂的,但是它具体信息在VCF ...

肺鱼属于叶鳍鱼(Sarcopterygii),泥盆纪时期适应了陆地气候,导致了产生所有陆地脊椎动物,包括人类.对于脊椎动物生活从水到陆的过渡伴随而来的进化和适应,肺鱼至关重要.这项重大的进化事件需要进 ...

简单解析自然人代征自然人代征主要面对自由职业者,这个优惠政策很好地解决了一些无法按照规定有资格自行申请开具发票的纳税人因为其经营活动需要不得不提供发票的实际情况,企业在其经营的过程中,经常可能会碰巧 ...

简单解析哪些行业可以核定征收现在很多企业都在税收洼地注册个人独资企业,是什么原因导致他们纷纷入驻呢?又有哪些行业可以核定征收呢? 首先个人独资企业不缴纳企业所得税,而是缴纳个人经营所得税:交完个税. ...

大部分人只看到目前火热的网络直播平台,就觉得很简单,想分一杯羹,但他们看到的只是表像,看不到更实质的部分.搭建直播平台并不是一个简单的企业网站或者图文网站,更不是一个简单的内容展示网站+两个移动平台的 ...

在前面我们用 ChIP-seq 的分析方法可视化了一下我的 WGS数据,结果我们的测序深度分布居然是跟基因组的genomic feature相关. 比如在TSS附近,就很明显看到了一个测序深度峰值(具 ...

今天的我们,还是继续探究那一个困扰我这么久的问题.为什么我作为堂堂正正的男性,明明X,Y染色体都只有一条,可是却测到了那么多的杂合突变的问题. 在之前,我们在QC阶段详细的探究了X,Y染色体的覆盖度和 ...

【直播】我的基因组78：简单解析一下蛋白编码基因的测序深度及覆盖度