【直播】我的基因组77：批量计算每个蛋白编码基因的测序深度及覆盖度 / 开普饭

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2408天关系再复杂,看完也门清! 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在人类转录组中占到了相当大的比例. 大量lncRNA在肿瘤中特 ...

我们对于人类基因组的奥秘知道的越多,对DNA的整体工作机制却懂得的更少.然而,一切奥秘还是有迹可寻... 编者案:"不要以为'垃圾基因'真的是垃圾" &q ...

写在前面 Kallisto 是一款 "Alignmnet-Free" 的转录组表达量估计的工具.其提出了一种 "pseudoalignment " 的概念,实则 ...

写在前面高通量测序已然成为qPCR一样普及到几乎每一个实验室.大量的物种被测序,对这些物种的序列信息进行分析,有助于我们更多地认识生物演化,预测更甚至了解基因的功能. 基于我个人的说法, 基因只是一 ...

上一讲中,我们对蛋白的编码基因的测序深度和覆盖度进行了统计,其中有的覆盖度很高,有的覆盖度却又很低,针对这个统计出的测序深度及覆盖度,我们就可以做一些简单的统计及分析. 首先,可以看看覆盖度为10%~ ...

看来本次直播我的基因组分析流程效果还不错,不少朋友跟着自己动手开始分析全基因组测试数据了,值得表扬.其中有好几个朋友留言向我反映公司给的统计报告里面的覆盖度的问题,如下图: 我在第 8讲中写道,每条染 ...

今天 IF函数在Excel表格中太难混了,今天又被一个"无名"函数秒杀了,它就是:MEDAIN函数. 怎么"秒杀"呢?这就得从Median函数的作用说起啦~ ...

批量插入图片好嗨!但是删除又是问题!没有办法全选! 点击上方"Excel和VBA",选择"置顶公众号" 致力于原创分享Excel的相关知识,源码,源文件打包提供 ...

https://doi.org/10.1038/s41467-021-23289-4 2021年5月24日,美国西奈山伊坎医学院冯智星等在Nature Communications发文题为Detect ...

小可来啦~MEDAIN函数,可能大家都觉得很陌生.但当你懂得用它时,你会发现它比IF函数还好用很多工作场合,还经常会拿它进行批量计算,效率胜过计算器! 那为什么还拿它跟IF函数比较?这就得从Medi ...

整理人:触电会郭麒当我们在聊直播的时候,我们到底在聊什么? 先定义一下,就是说当我们在聊直播的时候,我们到底在聊什么?直播赚钱这是4个字,首先定义一下直播,然后再谈赚钱.其实我们聊的是战略选择. 我 ...

在前面我们用 ChIP-seq 的分析方法可视化了一下我的 WGS数据,结果我们的测序深度分布居然是跟基因组的genomic feature相关. 比如在TSS附近,就很明显看到了一个测序深度峰值(具 ...

【直播】我的基因组77：批量计算每个蛋白编码基因的测序深度及覆盖度