NMDS分析

相关推荐

• R绘图笔记 | 小提琴图与漂亮的云雨图绘制

  关于绘图图,前面介绍了一些: R绘图笔记 | 一般的散点图绘制 R绘图笔记 | 柱状图绘制 R绘图笔记 | 直方图和核密度估计图的绘制 R绘图笔记 | 二维散点图与统计直方图组合 R绘图笔记 | 散点 ...

• 火山图|给你geneList，帮我标到火山图上

  火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大:纵坐标为P value(P值),值越大差异越显著.得名原因也许是因为结 ...

• 实用技术 | 如何用R绘制地图中的未定国界（含停火线）

  由于目前市面上出版的中国地图仍以1989年的国界线为准,因此即便之后中国与周边国家陆续签订了边界协定,完成了边界划定工作,但是有些边界划定并未在现行出版的地图上进行反映或更新,所以我们迄今会看到国内出 ...

• 小有所成题目一答案：nature高水平组组合图形绘制

  写在前面 小有所成题目一,在第二天就已经有一位朋友完成了,咱卧虎藏龙这居多.这两位朋友已经加入微生信生物VIP1群中. 目前还有两道没有人向我咨询过,也就是说没人弄出来? 高手题目二 小有所成题目二 ...

• 好的beta多样性排序图可不是加一个置信椭圆就好了

  写在前面 降维排序分析微生物群落的beta多样性,PCoA,NMDS,等都很常用.如果差异很明显,那么这些点无论是如何排布,都是很清晰的.但是如果是结果不好的排序,点与点之间机会错综复杂,乱七八糟的. ...

• ggClusterNet：手写算法在R语言中实现Gephi布局之一

  写在前面 像不像Gephi出图,Gephi布局还是有很多人喜欢,R语言确实不好实现,这个算法需要大量的迭代,让模块化点之间连线最短,不断修正,很耗费时间,我将聚类算法和修改后的距离算法合并起来并结合节 ...

• Python、R对小说进行文本挖掘和层次聚类可视化分析案例

  原文链接:http://tecdat.cn/?p=5673 <第二十二条军规>是美国作家约瑟夫·海勒创作的长篇小说,该小说以第二次世界大战为背景,通过对驻扎在地中海一个名叫皮亚诺扎岛(此岛 ...

• 昨晚熬夜整理的超级R绘图技巧——USing ggplot（下）

  # 加载需要的包 library(tidyverse) library(gcookbook) 21.使用facet_grid(x~.)分页 ggplot(iris,aes(Sepal.Length)) ...

• R语言绘制带有显著性字母标记的柱状图

  新 年 快 乐 Tao Wen 2019年1月6日 引子 想想看,人生不觉得过了好多,事情还是需要简单的做. library(tidyverse) library(agricolae) library ...

• R绘图笔记 | 柱状图绘制

  R绘图笔记 | 柱状图绘制