部分植物基因组数据库汇总
牛年大吉
植物基因组数据库：
1、NCBI中的genome，直接下载NCBI上的基因组文件
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/
2、植物基因组数据库（包含约30个左右的植物，具体查看:）
30个左右植物基因组对应列表下载
http://www.plantgdb.org/prj/GenomeBrowser/
3、 包含多个物种的基因组数据（如：柑橘、黄瓜、桉树、海棠等约100个左右）
100个左右植物基因组对应列表下载
https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html#
4、Ensembl数据库（植物）
70个左右植物基因组对应列表下载
http://plants.ensembl.org/species.html
5、拟南芥数据库
https://www.arabidopsis.org/index.jsp
6、另外一个综合性的（包含番茄，马铃薯，烟草、茄子等）
https://solgenomics.net/
7、水稻
http://rice.plantbiology.msu.edu/
8、马铃薯基因组数据库（较为全面）
http://solanaceae.plantbiology.msu.edu/index.shtml
9、百脉根
http://www.kazusa.or.jp/lotus/
10、豆科植物
https://legumeinfo.org/home
11、葡萄基因组
http://genomes.cribi.unipd.it/grape/
12、小麦
http://wheat-urgi.versailles.inra.fr/
https://triticeaetoolbox.org/wheat/
13、最全面的杨树整合数据（目前我看到的）
http://popgenie.org/
14、棉花
http://structuralbiology.cau.edu.cn/GraP/about.html
https://www.cottongen.org/
15、茶
http://www.plantkingdomgdb.com/tea_tree/
16、苜蓿
http://www.medicagohapmap.org/home/view
17、蔷薇科
https://www.rosaceae.org/
18、荞麦
http://buckwheat.kazusa.or.jp/index.html
19、各种柑类
https://www.citrusgenomedb.org/
20、萝卜
http://radish-genome.org/
21、茄子
http://eggplant.kazusa.or.jp/
22、各种瓜类（西瓜，甜瓜、南瓜等）
http://cucurbitgenomics.org/
23、梨
http://peargenome.njau.edu.cn/
24、被子植物基因组数据库
http://www.angiosperms.org/
25、菠萝
http://pineapple.angiosperms.org/pineapple/html/index.html
26、甘草
http://ngs-data-archive.psc.riken.jp/Gur-genome/index.pl
27、板栗
https://www.hardwoodgenomics.org/Genome-assembly/1962958
28、花生
http://peanutgr.fafu.edu.cn/Download.php
29、毛竹
http://server.ncgr.ac.cn/bamboo/index.php
30、薄荷
http://mints.plantbiology.msu.edu/
31、蓝莓
http://bioinformatics.towson.edu/BBGD/
http://gigadb.org/dataset/100537
32、橡胶草
https://bigd.big.ac.cn/gwh/Assembly/1/show
33、杜仲
https://bigd.big.ac.cn/search/?dbId=&q=Eucommia+ulmoides
33、圣罗勒
http://caps.ncbs.res.in/Ote/
34、青蒿
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Artemisia%20annua
35、向日葵
https://www.sunflowergenome.org/annotations-data/
36、胡桃科
http://www.juglandaceae.net/
37、物种如下图所示
http://medicinalplantgenomics.msu.edu/
38、杨树等
https://popgenie.org/
祝大家新春快乐，阖家幸福！
牛年大吉，多发Papper，顺利毕业，科研顺利！
蚂蚁生信和大家在新的一年里一起加油！
牛年更牛