SBC miRNA测序数据分析－丁香通 / 开普饭

miRNEST是一个整合了动物,植物和病毒microRNA数据的综合数据库,这是一个集成的microRNAs资源.该数据库由波兰Adam Mickiewicz大学 Izabela Makałowska ...

导语 TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好.在预测miRNA靶基因之前,首先需要确定转录本的3'UTR区域,TargetScan数据 ...

第一单元 lncRNA数据库长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码RNA.研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应.表观遗传调 ...

如本期推文,我们开始对外共享三年多以来的部分工作成果,即 sRNAanno - 一个植物小RNA注释数据库 ( www.plantsRNAs.org ).在这个数据库中,用户可以但不仅限于: 下载1 ...

miRNA测序背景简介小RNA是生物体内一类具有重要调控功能的非编码短小RNA的总称.大量研究已经证实,小RNA几乎参与调控了动植物所有的生命过程,包括细胞增殖,分化,凋亡等,并且与人类疾病的发生发 ...

引言前面两期主要为各位简单介绍了转录组测序以及转录组测序的方法,相信各位对转录组测序有了一定的了解.那么测序后进行数据分析,具体包含哪些分析内容呢?本文就详细为各位介绍一下. 分析内容 mRNA是具 ...

这个一个肿瘤外显子项目的文章发表并且公布的公共数据,我这里给出全套分析流程代码.只需要你肯实践,就可以运行成功. PS:有些后起之秀自己运营公众号或者博客喜欢批评我们这些老人,一味的堆砌代码不给解释, ...

耗费半年的时间精心制作了成套的生物信息学入门视频教程,并且在生信技能树联盟平台发布了这个长达74个小时全套生物信息学入门视频:生信技能树视频课程学习路径,这么好的视频还免费! 在B站看了看,大家学的热 ...

目前主流的ngs科研服务,包括WES和RNA-seq价格都是透明的,反正建库四五百块钱,测序都是60元一个G左右,也就是说10G数据量的wes也就是一千块钱,同理RNA-seq也是如此,而且有趣的是标 ...

早在2015年,那个我进入生信领域还不满两年,就看到了新闻,说百度CEO李彦宏将个人捐赠3000万元,支持百度与北京协和医学院针对食管癌基因组研究的合作. 当时的我仅仅是把它当做了新闻看了看,具体的合 ...

文章信息 Author:Yan Wu and Kun Zhang Date:2020 Mar 27 Journal:Nat Rev Nephrol(IF:19.684) 摘要在单细胞水平上对转录组进 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

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