把vcf文件转换为maf格式，肿瘤外显子上游分析教程到此为止 / 开普饭

目录一.什么是参考基因组和基因组注释?二.参考基因组版本命名1.常用人参考基因组对应表2.常用小鼠参考基因组对应表三.下载1.NCBI2.Ensemble3.GENCODE4.UCSC5.iGenom ...

一日一条命令-kneaddata 写在前面 kneaddata是一分结合质控和去除宿主的过程,集合了两个软件Trimmomatic和 Bowtie2,Trimmomatic作为质控软件应用的非常多,但 ...

NGS数据分析实践:02. 参考基因组及注释库的下载 - 目录 1. 参考基因组数据 2. 已知的SNP和Indel变异数据 3. annovar注释所需数据库的下载 4. 其他数据库系列文章: 二 ...

在平时聊微信过程中,微信在手机上的图片和在电脑上的图片,虽然在微信中可以查看,但是脱离微信后,在微信个人文件夹里看到的都是加密之后的DAT文件,这些都是个人的重要资料文件,却无法查看,需要整理的时候怎 ...

前面我们已经详细讲解了vaf,而且也对我的vcf文件进行了统计.[直播]我的基因组81:看看我的vcf文件的vaf分布情况文末我提到了一篇文章里面画出了TCGA的一个tumor样本的somatic ...

首先要下载并且得到人类基因组的外显子坐标记录文件这里我用的参考基因组版本仍然是hg19,所以去CCDS数据库里面下载对应版本,并且格式化成BED文件. wget ftp://ftp.ncbi.nl ...

TF之VGG系列:利用预先编制好的脚本data_convert .py文件将图片格式转换为tfrecord 格式转换代码 python data_convert2tfrecord.py -t pic ...

发布时间:2017/02/04 Illustrator和CorelDRAW是学平面设计必须会使用的矢量绘图软件,都可应用于出版.矢量插画绘图,广泛应用于印刷出版.海报书籍排版.多媒体图像处理.专业插画 ...

在我们的日常生活或工作中,在某些特定的场合,我们希望我们自己的文档只能查看,且无法被修改.此时我们可以将word文档转换成pdf格式,这样这个文档基本上就不可以修改了.那么如何将word文档转换为PD ...

查看没有扩展名的视频文件的格式,有几种查看方法如下: 一.右击文件,点击属性,在[常规]里查看文件格式. 二.在win7系统中,可以直接左击选中文件,在下方就会出现信息. 注意:一次只能选中一个文件进 ...

制作完Excel表格后,为了防止表格中的数据被改动,很多人会选择将其转换为PDF文件,但转换后的文件总会出现格式错误,这可能是由于使用的软件不合适导致的,建议使用ABBYY FineReader PD ...

需求客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt image.png test.vcf image.png 代码实现 ...

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