技术贴 | R语言：绘制基因组基因箭头图 / 开普饭

火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大:纵坐标为P value(P值),值越大差异越显著.得名原因也许是因为结 ...

最近看到很多人问下面这个图怎么绘制,看着确实不错.于是我查了一些资料,这个图叫split violin或者half violin,本质上是一种小提琴图.参考代码在https://gist.github ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较.可以添加多种图展信息,如热图.散点图等. 本文目标: 可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮.可 ...

本文由yang根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在组学数据挖掘中在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是G ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用psych包计算两组小样本的相关性并进行热图可视化,但当样本数据量非常大时,psych包会耗费的时 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在多组学数据关联挖掘中,在我们筛选到目标基因集以及目标蛋白质集合或目标代谢物集合后,在进行基因与蛋白质或代谢关联 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读饼图可以展示整体中各个部分占整体的比例.利用label,col,border可分别调整pie图的标签.饼颜色.边颜色 ...

交互效应分析在SCI中是一个重要的组成,可以表示特殊的人群(也就是亚组)中自变量和因变量的结果关系,可以说是高分SCI必做的项目,在SCI中,这一部分结果很多都是以森林图来展示,这样结果又直观有方便分 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...

原始数据为1. HM_39mappingfile.csv,即分组信息 2. adiv_all_sorted.txt,作图所需的值.如图所示: 程序如下: library("ggplot2&q ...

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