技术贴 | R语言：如何绘制合并气泡图？ / 开普饭

GO是Gene Ontology的简称,是基因功能国际标准分类体系.它旨在建立一个适用于各种物种的,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准.GO分为分子功能(Mo ...

火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大:纵坐标为P value(P值),值越大差异越显著.得名原因也许是因为结 ...

写在前面在构造更加合适我们解决问题的网络图layout过程中,我学习到了一些有意思的数据排布.这里展示给大家. 多边形–五边形 library(tidyverse) pentagon <- t ...

上篇文章小编为各位小伙伴介绍了转录组分析的第八步--富集分析.通过富集分析可了解各个基因行使的功能.那么这次小编就以2020年8月发表在Viruses上的文章" Transcriptome ...

今天是生信星球陪你的第803天大神一句话,菜鸟跑半年.我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手 ...

本文由微科盟阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例介绍如何用R语言gggenes函数包把基因预测得到的gff或gtf文件(含基因位置信息)中的基因类型.位置可视化 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用psych包计算两组小样本的相关性并进行热图可视化,但当样本数据量非常大时,psych包会耗费的时 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在多组学数据关联挖掘中,在我们筛选到目标基因集以及目标蛋白质集合或目标代谢物集合后,在进行基因与蛋白质或代谢关联 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读饼图可以展示整体中各个部分占整体的比例.利用label,col,border可分别调整pie图的标签.饼颜色.边颜色 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...

原始数据: R语言脚本: install.packages("vioplot")#安装vioplot包 library("vioplot") #安装和载入vio ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例展示R语言组学关联分析的方法.宏基因组数据以KO-样品丰度表为例.代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例.基 ...

利用R语言堆叠图,我们可以将一个项目中所有样品的物种组成展示出来.下面介绍如何利用R语言进行物种组成分析和可视化.过程分为以下几步: 1)模拟丰度矩阵: 2)模拟分组: 3)标准化丰度: 4)调整格式 ...

导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...

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