Omics精进05|临床Gene Panel检测-实验&&生物信息学分析（带UMI标签） / 开普饭

不知不觉cellranger已经更新到6.0了.前面已经介绍了4.5,今天介绍下6.0 cellranger更新到4啦(全新使用教程) cellranger更新到5啦(全新使用教程) CellRang ...

我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式,然后利用sra-tools分为read.barcode+UMI.index三个fastq.gz文件.最后直接利用cellranger即 ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

写在前面最近主要忙一些植物群体基因组数据的项目.前面提过,赶时间,全基因组的 SNP Calling 使用 GATK 流程,还是需要跑上两三天.但这个还是耗时,并不一定能够赶上工期.于是我将目标转移 ...

感觉最近接触的生物信息学知识越多,越对大数据时代的到来更有同感了.现在的研究者,其实很多都可以自己在家里做了,大量的数据基本都是公开的, 但是一个人闭门造车成就真的有限,与他人交流的思想碰撞还是蛮重要 ...

本文介绍临床Gene Panel检测的「实验流程」及「生物信息学分析流程」(下图为MSK-IMPACT 468基因panel的检测流程,各产品流程也大同小异,本文参考此流程). 个人能力有限,欢迎指出 ...

本文目录国外泛癌Panel产品国内癌种小Panel产品 Panel长啥样 Panel关键参数 Panel设计 reference 国内外泛癌Panel产品「获FDA批准」,目前仅有以下三个泛癌p ...

4种策略简介 whole-genome sequencing (WGS).whole-exome sequencing (WES).targeted-panel sequencing(Gene pan ...

专业的解读报告, 报告有临床意义的变异,才能及时辅助医生提供个性化治疗: 「报告解读」在临床基因检测中扮演非常重要的角色,「非常依赖经验和专业知识」,因个人知识有限,「本文简单介绍」. ❞ Gene ...

临床常用生物化学检测:血糖及其代谢产物的检测重点难点掌握血糖及其代谢产物检测的临床意义,血清脂质和脂蛋白检测及临床意义,血清电解质检测及临床意义,血清铁及其代谢产物检测临床意义,心肌酶和心肌蛋白 ...

血清脂质和脂蛋白检测一.血清脂质检测(一)总胆固醇测定增高1.动脉粥样硬化所致的心.脑血管疾病2.各种高脂蛋白血症.胆汁淤积性黄疸.甲状腺功能减退症.类脂性肾病.肾病综合征.糖尿病等3.长期吸烟.饮酒 ...

血清电解质检测血清电解质检测一.血清阳离子检测 (一)血钾测定高钾血症的发生机制和原因机制原因摄入过多高钾饮食.输注大量钾盐.输入大量库存血液等排出减少 1.急性肾衰竭少尿期.肾上腺皮 ...

血清铁及其代谢产物检测一.血清铁检测增高或减低机制原因血清铁增高 1.利用障碍铁粒幼细胞贫血.再生障碍性贫血.铅中毒等 2.释放增多溶血性贫血.急性肝炎.慢性活动性肝炎等 3.铁蛋白增多 ...

心肌酶和心肌蛋白检测心肌酶和心肌蛋白检测心肌损伤的生物化学指标意义生物化学指标最早出现肌红蛋白.CK亚型.糖原磷酸化酶同工酶BB.心脏脂肪酸结合蛋白特异性高 cTnI.cTnT.CK-M ...

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