序列提取 - 《-零命令行-生信下游数据分析》- 第一弹 / 开普饭

写在前面我们在处理GEO芯片数据的时候,经常会碰到芯片的数据的注释文件没有提供基因名,只有基因的序列.替代的解决办法就是对所有的注释数据来进行批量的blast,利用注释文件提供的序列来通过blast ...

写在前面通过我几天的学习,我发现,seqkit十分好用,将序列的各种操作都囊括进去,加入多线程,我个人认为这将是非常好的胶水,在处理无论是基因组还是其他组学.定是一个必学神器.注意一下教程在0.15 ...

首先提出一个问题:我们在测序公司得到数据,可能他们会给跑出otu.table文件,但是没有进化树,在影响到了后续的Aplha,beta多样性分析: 让我们开始解决这个问题: # 物种注释(如果没有注释 ...

我前面写到了生信分析人员如何入门linux和perl,后面还会写R和python的总结,但是在这中间我想插入一个脚本实战指南.其实在我前两篇日志里面也重点提到了学习编程语言最重要的就是实战了,也点出了 ...

写在前面在"肉眼可见"的范围内,与生信靠得上边的公众号却一个劲儿地推送"界面化操作软件"的,可能就我一个.毕竟我暂时还没有我觉得拿得出手的东西来分享.可能是因 ...

今天给大家介绍一篇去年11月刚刚online的单基因单基因生信+验证.8月份投稿,10月份接收,11月online,又是人生赢家.对于单基因的分析,挑选基因最为关键.小编认为容易发表的基因要符合以下几 ...

大家好,今天要和大家分享的是2020年12月份发表的一篇文章:"Genomicinvestigation of co-targeting tumor immune microenvironm ...

一个简洁明了的文件目录组织方式可以使我们快速地了解一个项目,无论是自己的项目还是别人的项目.一个团队使用类似的文件组织方式可以方便大家进行合作沟通,互相学习. 本文主要讲述了如何组织一个生物信息学项目 ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

写在"写在前面"的前面有一句名言说得特别好,这里必须分享! "如果你经常需要花费超过三秒钟去完成一个简单的事情,那么说明,你没用对工具.--- CJ". 写在 ...

SCI生信文章复现系列(二)--生存分析及基因表达相关性分析人人向往的生信文章究竟是怎么做出来的?生信小白如何从零起步,读懂生信图.做出漂亮的生信图片?SCI生信文章复现系列为你打开新世界大门,带你 ...

一文解读非肿瘤纯生信文章从小白的角度,30分钟复现生信套路.今天为大家带来一篇2020年5月发表于中山大学学报的生信文章<基于生物信息学探讨合并心力衰竭的扩张型心肌病靶基因的预测>的复现 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2533天 7+纯生信ceRNA文章复现在pubmed搜索ceRNA,发现很多实验类的文章,做了很多内容,但是只发了2-3分,所以今天想和大家一起学习2021年1月发表于 ...

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