特殊物种cellranger基因组质量评估 / 开普饭

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

写在前面 Mapman 是一款为植物通路分析专门设计的界面化软件,发表于2004年,其后不断更新,直到今日.我们也常常能在近期发表的一些文章中看到 Mapman 输出图稿的身影.在几年前,我写了系列 ...

写在前面这两天有看到几个用户朋友在生信札记讨论群中讨论了基因结构图的绘制.看到其他用户一直推荐 GSDS,我便也没有作声,毕竟 GSDS 确实是很优秀的网页软件.而现实情况是,近期 GSDS 网站无 ...

写在前面目前基因组测序和组装成本几乎已经到任何一个课题组都可以单独负担的价码,大量物种的基因组序列被测定和释放.与此同时,对应的基因结构注释信息文件,如GTF或GFF3文件等,也可公开下载. 对于绝 ...

自从X线被发现之后,很快被引入医学领域.在兽医影像学领域,X线诊断技术经历了传统的屏-片系统.CR到现在的数字系统DR.目前由于DR系统获取图像方便快捷.图像质量清晰.技术要求小.价格相对合理等优点, ...

近年来,越来越多的学术机构开始重视并参与实施负责任的学术评估工作.很多学术机构认为,期刊影响因子不应该成为评估学者研究水平的唯一工具和标准.然而,避免对期刊影响因子的过分依赖,只能解决学术评估工作现存 ...

为什么要进行数据质量评估很多刚入门的数据分析师,拿到数据后会立刻开始对数据进行各种探查.统计分析等,企图能立即发现数据背后隐藏的信息和知识.然而忙活了一阵才颓然发现,并不能提炼出太多有价值的信息,白 ...

机器之心专栏机器之心编辑部本文介绍了微信搜索数据质量团队在 AAAI 2021 大会发表的两篇研究. 随着社交媒体和移动信息流应用的发展,涌现出了许多用户生成内容模式下的自媒体应用,每个用户都可以 ...

学习目标探讨ChIP-seq数据质量低的来源理解链交叉相关性( strand cross-correlation) 使用phantompeakqualtools计算交叉相关性和其他相关的质控度量值 ...

ATAC系列连载: 第1篇:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同第2篇:原始数据的质控.比对和过滤第3篇:用MACS2软件call peaks 第4篇:对ATAC-Seq/ChI ...

前面我提到了有学员提问:新的ngs流程该如何学习之m6A学习大纲,所以我给了他优秀学员想要MeRIP-Seq/m6A-seq教程,但是他似乎是并没有主动给我投稿,不过我们的转录组授课讲师也感兴趣了这个 ...

最近有一些朋友咨询新物种的基因组组装相关数据分析,我其实是七年前有参与过一点点啦,是大黄鱼等基因组,好像还是什么973项目,那个时候基因组都是cns级别文章.但是自从离开北京后一直做的都是人类疾病,尤 ...

写在前面三年前,那时往"全国植物基因组会议"投个了摘要,也准备了下墙报,有点期待能得到点认可.当然和以前一样,优秀跟我没啥关系.这是结果,结果当然不会反过来影响过程.为了让 TB ...

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