单细胞测序数据库 / 开普饭

写在前面你现在看到的是文献俱乐部2019年笔记分享第一弹,我将会在春节7天连续分享,目录如下: 2019年1月份第1周(总第49周)单细胞转录组探索CAFs的功能和空间异质性 2019年1月份第2周 ...

作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,积累了大量研究数据.Cell BLAST是一个自带高质量参考数据库的scRNA-seq数据检索/注释工具.这个网站由北京大学的研究团队 ...

#背景介绍单细胞测序分析可以解决肿瘤异质性的问题,提高实验数据分析的准确性,对临床医生对疾病的诊断.检测.治疗提供非常有价值的帮助,也是现今生命科学研究的焦点.但测序费用的昂贵让很多怀着科研梦想的人 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 面向单细胞的技术革命,让我们得以进入新的研究层面, ...

最近各个公众号都在鼓吹单细胞转录组数据套路,感觉这样的科研风气不好,数据挖掘这个技能最大的作用应该是避免大家重复浪费科研经费去做一些明明可以通过分析公共数据库拿到的结论! 比如你研究的癌症里面哪些基因 ...

目前已有的单细胞数据库中,SCDevDB专注的是人不同发育通路的单细胞基因表达谱,JingleBells提供有关免疫相关数据集的scRNA-seq BAM文件,SCPortalen集成了单细胞宏数据, ...

对于对于测序而言,单细胞测序算是很火的一个测序技术了.简单来说单细胞测序技术的,就是对每一个细胞来进行测序.相较于之前的RNA-seq而言,我们其实是对某一块组织所有的RNA进行检测,由于一块组织里面 ...

基因转录的过程当中,基因由DNA转录成mRNA的过程受到很多因素的调控.其中就包括了转录因子的调控.转录因子调控的一个主要的过程是转录因子和基因启动子区进行结合进而来对其表达进行调控.由于每个转录因子 ...

前面我们开通了明码标价专栏: 都是公共数据的处理,其实也同步给了全部的代码,也算是一种粉丝福利吧!因为我们一直在面向数据的教程服务,确实没有自己的实验室没有自己的测序仪,所以对很多粉丝的测序要求只能说 ...

RNA测序(RNA-seq)已成为差异基因表达和mRNA差异剪接的转录组范围分析不可或缺的工具.JingleBells将单细胞数据划分为免疫和非免疫类,共收录120篇免疫相关以及182篇非免疫的单细胞 ...

# 背景介绍单细胞相关的研究数据常常以原始数据的形式存储,由于需要使用复杂的计算流程进行数据处理,生物研究人员很难访问这种格式的数据.虽然目前已经有一些数据库收集.管理和整合scRNA-seq数据和 ...

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目: 文献速递(简短介绍,扩充知识面) 文献 ...

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