使用biopython可视化染色体和基因元件 / 开普饭

Hi-C的起源与发展 1953年,沃森和克里克发现DNA双螺旋结构,这标志着生物界进入基因组的研究时代.此后不久,胰岛素的氨基酸序列得以破解,DNA测序逐渐成为生物学家的重要目标.1975年Frede ...

前面我们已经详细讲解过如何根据窗口来统计每条染色体的每个片段的GC含量,还有平均测序深度,请大家自行前往前面查看脚本及实现方式![直播]我的基因组47:测序深度和GC含量的关系那么如果得到了如下的数 ...

为了让圈圈图能一层层的添加,我用了一个很巧妙的方式,希望你能看懂! 每个图层对应的数据我都展示给大家看了,希望大家能明白学习的技巧,在脑海中有一个映射关系.什么样的数据映射到了圈圈上面! 我先讲解了画 ...

最近小编在后台看到有的小伙伴留言咨询曼哈顿图(Manhattan Plot) 的绘制方法,小编一开始也是比较不了解,奈何我又是一个宠读者的小编,这就汇总了曼哈顿图(Manhattan Plot) R和 ...

最近接到粉丝求助,有一篇文献写到:We found that 16 differentially expressed genes (Table 2) represented by specific p ...

一.人类基因组有多大参照UCSC提供的hg38版本,也是目前常用的人类参考基因组 http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg3 ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

gsea分析这方面教程我在<生信技能树>公众号写了不少了,不管是芯片还是测序的表达矩阵,都是一样的,把全部基因排序即可: 比如你有2万个基因,你根据自己的条件分组后算差异情况,根据差异把基 ...

0.scater包方法在scaterR包里,有个函数plotHighestExprs,可自动根据SingleCellExperiment对象数据进行绘制.但有个缺点就是太慢了,具体操作如下 libr ...

写在前面最近做了一些转录组数据分析.想想,上一次这么精细地分析转录组数据,都是三五年前的事情.整个实验设计是一个器官的不同发育阶段.按照最传统的做法,不同阶段,两两间进行差异表达分析,于是会产生系列 ...

"Nature red in tooth and claw" 用于描述自然界的残酷无情并不过分,血染的爪与牙确实是自然界动物繁殖生存之道.一些没有 "爪与牙" ...

通知备用:如果以后读者无法再阅读到本公号的更新,可以去网易搜索同名的网易号.海外的读者也可以下载Telegram , 然后再手机浏览器中打开链接"https://t.me/joinchat ...

编者注:这篇文章写于2012-06-22,今天搜索此文时,发现已被新浪博客删除,而且连底稿也没有找到.有两位转载此文的博客也无法访问.幸得对博文网页做过保存. 此文内容,笔者一直视为"诺贝尔 ...

使用biopython可视化染色体和基因元件