技术贴 | 16S专题 | 初学者如何深入解读16S rDNA扩增子测序数据，从而选择自己的分析步骤（满满干货～） / 开普饭

高通量测序平台的出现彻底改变了对复杂微生物群落的研究.最常见的是,标记基因(例如16S rRNA和18S rRNA基因)的扩增和测序,提供定性和定量(即相对丰度)数据.可用于进行标记基因分析的方法多种 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读明明测了100000条序列,为什么我用dada2得到的OTU丰度只有8000?是人性的扭曲还是道德的沦丧? ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本系列的上一篇推文,即"开篇"中已经描述了宏基因组研究的基本思路和方法.先回顾一下,首先是收集样 ...

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单细胞转录市场活动 for NGS, we only do RNA-seq forever! 活动背景前两年在生信技能树平台的帮助下,我们开展了多期生物信息学培训班.合作了很多RNAseq相关的NG ...

导读高通量16S测序经济实惠.周期短,是许多微生物组学尤其是环境微生态方向科研工作者的有力武器. 课题组经费不够,测了16S只能自己分析(省钱啊!!).这里为需要自己处理16S数据的同学,整理了 ...

编前语随着假期的结束,老师们的数据分析结果也陆陆续续回来了或即将回来. 然而,面对一大堆的图表文件,是不是有种明知此地有宝藏却不知从何寻起的懵圈感? 没关系,在接下来的一个月里,小编将在每周五和您一 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

编前语一眨眼间,本专题已接近尾声了,感谢大家的陪伴,也谢谢江老师的理解与包容,同时也希望本专题有帮到大家. 我们16S专题一共四篇,已发表了<16S简介>.<16S结题报告解读&g ...

编前语在分享之前,我想先对前两期留言肯定16S专题的小伙伴们说声谢谢,我是一名生信工程师,平时做项目和自我学习占据了我大部分的时间,这个专题是我挤出业余时间写的,但你们的肯定.鼓励与支持是我继续写下 ...

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