省事地获取已公开测序数据的下载链接(.sra|.fastq.gz)
相关推荐
-
侠之大者,为老数据接盘
粉丝来稿 写在前面 在几乎所有模式植物转录组测序技术都做烂的今天,始终有一些植物因为种种原因鲜有问津.例如小麦,就像是开在奢侈品商场的黄焖鸡:有钱的人未必瞧得上,没钱的也压根就不会去光顾.不过这么多年 ...
-
SRA数据库不仅仅是可以存放fastq原始数据
最近刷单细胞文章看到了一个很有意思数据存放细节,这个文献的标题是:<Single-cell sequencing links multiregional immune landscapes an ...
-
什么,ENA和SRA数据库存放的单细胞转录组测序数据并不一致啊?
是时候把生信技能树的舞台交给后辈! 粉丝来稿 作者:黑川五郎 写在前面 单细胞转录组以10X公司为主流,单细胞天地公众号详细介绍了cellranger流程,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一 ...
-
【数据库】SRA数据库介绍及数据下载
[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...
-
看优秀本科生如何一周内学会Linux进而搞定RNA-seq上游分析
距离公布要带500个优秀本科生入门生物信息学的活动不到一个月,虽然真正入选不到一百,但是培养成绩喜人,出勤率接近百分之百,大部分人在短短两个星期就完成了R基础知识学习,Linux认知,甚至看完了转录组 ...
-
初步尝试从AWS下载SRA原始数据
希望所有学员都可以站在生信技能树的舞台上发光发热! 下面是粉丝随机投稿 追随生信技能树的脚步,学习生信已经有半年多了.看了哔哩哔哩上的视频,也跑了健明老师的代码.以为自己起码入门了,但是真正分析感兴趣 ...
-
m6A图文复现02-数据下载和质控
但很多粉丝留言表示这些英文教程看不懂,数据也很分散,没有中文解说实在是很难跟下来,希望我们出一个手把手系列教程. 这个全套 MeRIP-seq 图表复现代码在GitHub:https://github ...
-
lncRNA实战项目-第三步-了解参考基因组及注释文件
响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! 下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProj ...
-
0-跟着science学宏基因组-背景和数据
写在前面 首先说几句话: 本小结代码不需要运行,只是告诉大家数据来源和这份代码的来源: 本小结的软件也不需要安装. 如果没有Ubuntu的随便安装一个就可以16-20都可以运行,例如: 下载一个Qii ...
-
获取已公开个人信息并出售牟利是否构罪?
作者:周光权,清华大学法学院教授. 来源:<法治日报>2021年9月22日第9版,原题为<获取已公开个人信息并出售牟利的定罪争议>. 对于未经被收集者同意,获取部分 ...
-
周光权:获取已公开个人信息并出售牟利的定罪争议
( 2021-09-22 ) 稿件来源:法治日报法学院□ 周光权 (清华大学法学院教授)对于未经被收集者同意,获取部分已在公众网络上公开的企业登记信息.征信信息并出售或提供给他人的情形是否定罪,在实务 ...
-
借用别人的已发表测序数据,让自己的研究结果更丰满
免疫逃避 机体的免疫可以通过各种各样的方法抵御各种各样病原体的入侵,但是,病原体也可以通过各种手段来逃避免疫系统的攻击和追杀,实现它在机体内存活并伺机扩散的目的,也就是免疫逃避. 摘要 PD-L1和P ...
-
公共数据挖掘|已有GWAS数据的下载及挖掘(一)
公共数据挖掘|已有GWAS数据的下载及挖掘(一) 浏览 1.4 万·讨论 3 小生小声楼主 发布于 2018-10-31 只看楼主 这个帖子发布于 2 年零 249 天前,其中的信息可能已发生改变或有 ...
-
Power Query工作案例综合实战精选20篇及配套数据/动画下载链接
领导就要这种格式的数据汇总,你能怎么办?领导就要这种格式的数据汇总之续篇结合"领导就要这种非标准格式的报表"案例,谈谈PQ与PP如何结合应用的问题结合CELL函数实现数据源的动态化 ...
-
3000份水稻重测序数据全部公开
感觉最近接触的生物信息学知识越多,越对大数据时代的到来更有同感了.现在的研究者,其实很多都可以自己在家里做了,大量的数据基本都是公开的, 但是一个人闭门造车成就真的有限,与他人交流的思想碰撞还是蛮重要 ...
-
如何获取已测序的基因组(动物,植物,微生物)
近来课题需要,要看一个所有植物的基因组是否存在某个有趣的现象....但是手上并没有完全的列表.JGI上也只是收录了71个物种...无解之下,百度,微信都搜索完啦... 前面嘛,有朋友说我不喜欢分享,我 ...
-
PBJ | 基于149份材料靶向测序数据结合全基因组关联分析揭示小麦光能利用相关遗传位点
普通小麦是一个由三个密切相关的亚基因(AABBDD)组成的异源六倍体.它被认为起源于两次多倍化事件:第一次是野生四倍体小麦(AA)与未发现的节节麦谱系(BB)杂交形成的四倍体,距今约50万年;第二次是 ...
-
每次CT检查都有辐射,对患者的伤害到底有多大?公开真实数据
"小九,我们单位今年体检加了CT项目,听说这玩意儿照多了会得癌啊?能检查吗?" "我今年生病住院,前前后后做了4次CT,做这么多次是不是吃了好多辐射?" &qu ...