SRA数据库不仅仅是可以存放fastq原始数据 / 开普饭

写在前面课题需要,前述,在TBtools中开放了一个SraExperimentXML2InfoTable的功能.在这个功能的辅助下,我们较快的完成了阶段任务.筛选数据完成了,但是下载数据却出现了问题 ...

[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...

导言前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...

如何高效又简单地省时地获得SRA公共数据的Fastq格式数据陈胖子下载NCBI SRA数据库上的公共数据,整体上还是大部分搞数据分析,又想灌水的人必做的一个事情. 其实直接使用官网推荐的工具asp ...

大概一年前,我曾经希望使用"微信圈子"(估计是微信的两大流量转化方式 - 微信小商店和微信圈子之一)来承担 TBtools 用户社群的交流作用,更或者作为个人记录和分享一些碎 ...

最近下载一个文章的数据,发现3个数据,就有3种结果:$cat logs/down.log.4$cat need.sra.list |while read id;do ( ~/biosoft/sra ...

前面我们大量NGS相关教程视频免费发布在B站,都是使用NCBI的SRA数据库下载sra文件后转为fastq进行NGS分析流程,其实是因为我本人一直不在中国大陆,所以没有网络问题.但是学生们不一样,同样 ...

四年前我写过介绍GEO和SRA数据库的推文 : 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够解读SRA数据库规律一文就够其实就是耗费一点时间去摸索如何在这两个数据库里面查询下载自己感兴趣的文章的数据.注 ...

是时候把生信技能树的舞台交给后辈! 粉丝来稿作者:黑川五郎写在前面单细胞转录组以10X公司为主流,单细胞天地公众号详细介绍了cellranger流程,大家可以自行前往学习,如下: 单细胞实战(一 ...

简介 SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案,是国际核苷酸序列数据库协作(INSDC)的一部分,包括NCBI序列阅读档案(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库. 日本(DDBJ). ...

做数据分析的朋友都知道NGS测序数据一般会上传到SRA数据库里面,而这个数据库是可以免费无限制下载的,所以对它有基本的了解是一个生物信息学工程师的基本素养.下面就跟着我一起来掌握它吧. 一般的文章里面 ...

电脑提速误删文件恢复 WAF rar密码破解 JS加密 sqlite是款不错的数据库,使用方便,不需要事先安装软件,事先建表.很多人担心它的性能和数据存储量问题. 比如有的网友问:Sqlite数据库 ...

SRA数据库不仅仅是可以存放fastq原始数据