【直播】我的基因组 40：不同lane的bam文件的比较 / 开普饭

写在前面 Kallisto 是一款 "Alignmnet-Free" 的转录组表达量估计的工具.其提出了一种 "pseudoalignment " 的概念,实则 ...

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

昨天,我们了解了一下SAM格式的比对结果,不知道大家理解的怎么样.但是全基因组测序数据实在是太大了,即使比对后把sam文件压缩成二进制的bam文件也还有55G(如何压缩转换可查看直播十二),如果完整的 ...

本文由 TVB剧透君作者 JacksonTsang 原创转载请注明:严厉打击任何抄袭行为,势必全网投诉到底! 现年40岁台湾人气天后萧亚轩(Elva),近年因为患上抑郁症而要全面停工休养,广大粉 ...

你也不用让所有人都满意定义你生活的不是父母,不是老师更不是领导,而是你自己你要好好活着去证明自己闪闪发光的人生 --<这不是你的错> 6月13日晚间8点,主持人何季颖老师轻读:郁金 ...

在此之前,我们分别在十七,十八讲中讲到了multiple mapping,PCR duplication的情况,在分析我的基因组时呢,肯定要去除掉multiple mapping.PCR duplic ...

上一讲我们说道Qualimap这个软件,那我们现在仔细了解下这个软件吧! 比如下面这个覆盖度与测序深度的图来说: 如果我们自己要对55G的bam文件进行统计,可以sort好之后用samtools的mp ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

这一讲中,我们对VCF中的"VAF"简单的来看一起,如果你对VCF文件还不了解的话,那你就要自我批评一下了.在基因组直播刚开始的时候,我还专门对VCF文件进行了简述.[直播]我的基 ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

18:15,CCTV5直播:苏炳添冲100米决赛,碾压3大日本名将北京时间8月1日消息,东京奥运会将展开乒乓球团体项目的争夺.而就在比赛开始之前,国际乒联官方发布重磅消息:中国选手刘诗雯因为肘伤退出 ...

【直播】我的基因组 40：不同lane的bam文件的比较