450K甲基化芯片简介操作以及统计分析 / 开普饭

现今的生信领域几乎就是和无数的序列打交道,而这些序列的来源就是如今风靡的高通量测序技术,现今的测序不论是测RNA.DNA.miRNA还是ChIP-Seq等等,都是基于NGS(二代测序,next-gen ...

上周我们为大家讲解了二代测序的开山鼻祖,Roche公司的454测序技术. 这周,让我们来聊一聊,ABI公司的SOLiD测序技术. 历史 ABI公司的SOLiD测序技术最初是由哈佛大学 Church 研 ...

因分型 (Genotyping) 是利用生物学检测方法测定个体基因型 (Genotype) 的技术.又称为基因型分析 (Genotypic assay). SNP SNP全称Single Nucleo ...

来源:云起IVD,作者:阁主Pro 云起IVD 行到水穷处,坐看云起IVD 64篇原创内容公众号分子诊断技术是用分子生物学方法针对人体及各种病原体的遗传物质的表达及结构进行检测,从而达到预测及诊断 ...

写在前面 Illumina甲基化芯片目前仍是很多实验室做甲基化项目的首选,尤其是对于大样本研究而言,其性价比相当高.这种芯片的发展主要经历了27K.450K以及850K,目前积累的数据主要是450K芯 ...

早在我们举办甲基化芯片专题学习的时候,见: 450K甲基化芯片数据处理传送门就有非常棒的一站式教程投稿,也因此我结识了优秀的六六,以及其教程大力推荐的R包作者,见: 850K甲基化芯片数据的分析但 ...

一.Illumina甲基化芯片人类的许多疾病(包括癌症)是由于异常的甲基化引起的.Illumina甲基化芯片是一种DNA甲基化高通量筛选技术,精确到单个碱基的甲基化变化.单碱基分辨率实现了基因区域和 ...

一.简介 DNA甲基化是核酸和蛋白质的一种重要修饰方式,通过影响染色质结构,DNA构象,稳定性以及与蛋白质相互作用等方式来调节基因的表达和关闭,与各种细胞功能.胚胎发育.癌症发生.衰老等许多生理性状相 ...

瑞芯微RK3568芯片是一款定位中高端的通用型SOC,采用22nm制程工艺,集成4核arm架构A55处理器和Mali G52 2EE图形处理器,支持4K解码和1080P编码.RK3568支持SATA/ ...

USB是英文Universal Serial Bus的缩写,中文含义是"通用串行总线".它是一种应用在PC领域的新型接口技术.早在1995年,就已经有PC机带有USB接口了,但由于 ...

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长,前面已经发过一个: 学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门,我呢,恰好不久前用一个集成度很 ...

一次偶然的搜索中发现biocondutor有个甲基化芯片的分析流程,刚好可以学习下,写的真的很棒. Bioconductor的DNA methylation workflow可以在http://www ...

关于GEOquery在GEO公共数据库挖掘的重要性我已经多次强调和介绍了,不赘述,不过它可不只是用来下载表达芯片矩阵的,也可以下载甲基化芯片信号矩阵,也是贝塔值矩阵. 代码如下: require(GE ...

450K甲基化芯片 简介操作以及统计分析