450K甲基化芯片数据处理传送门 / 开普饭

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前言因为组里面出了一批甲基化测序数据,使用的技术为BS-seq,处理的时候顺带记录了学习过程,演示使用数据为官方提供的example.fastq. DNA甲基化及CpG岛定义了解 DNA甲基化(英语 ...

一.简介 DNA甲基化是核酸和蛋白质的一种重要修饰方式,通过影响染色质结构,DNA构象,稳定性以及与蛋白质相互作用等方式来调节基因的表达和关闭,与各种细胞功能.胚胎发育.癌症发生.衰老等许多生理性状相 ...

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长,前面已经发过一个: 学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门,我呢,恰好不久前用一个集成度很 ...

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数据是一切的开始,前面我们介绍了一些背景知识,主要是理解什么是DNA甲基化,为什么要检测它,以及芯片和测序两个方向的DNA甲基化检测技术.具体介绍在:甲基化的一些基础知识,也了解了甲基化芯片的一般分析 ...

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