入门流程 | 三代测序基因组从[组装]到[评估]- Pacbio、Flye、Quast
相关推荐
-
转录组学习五(reads比对)
转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...
-
MPB:深大李猛组-基于PacBio SMRT三代测序的红树林沉积物真菌群落的研究
为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...
-
【直播】我的基因组24:用GATK对SAM格式的文件进行重排
GATK教程我以前写过(GATK使用注意事项:http://www.bio-info-trainee.com/838.html) 这个步骤分成2个小步骤: 首先用RealignerTargetCrea ...
-
宏基因组分析专题(5):从宏基因组数据中得到高质量的基因组数据- MetaBAT的安装和使用
生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...
-
【直播】我的基因组(十二):先粗略看看几个基因吧
昨天我们说到,测序得到的fastq文件map到基因组之后,我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件.SAM的全称是sequence alignment/map format,而BAM就是SAM ...
-
Nature子刊:三代测序重构菌株水平宏基因组序列的计算框架iGDA
https://doi.org/10.1038/s41467-021-23289-4 2021年5月24日,美国西奈山伊坎医学院冯智星等在Nature Communications发文题为Detect ...
-
三代全基因组测序成本降至1万元,有望成为打开基因测序基层市场的一把钥匙
希望组CEO汪德鹏第一次接触到三代测序技术,是在2009年.当时有传言说三代技术可以在15分钟内就完成一个全基因组测序,而且成本仅在大约1000美元左右,全世界都为之震惊. 但从实测的数据来看,无论是 ...
-
菜鸟入门:DNA测序结果图如何看?
作为一枚临床上大夫,通常看到的基因检测报告是长下面这样的,你基本不会关心他是咋么来的?咋么没的一般很简单(病人搞丢了). 但是实验狗就真的没有辣么好的运气了,你需要刨他们的祖坟,你甚至会疑惑一代测序和 ...
-
DAY7 一二三代测序,重一二代测序原理,三代略看,必备words
image.png 一代测序:Sanger测序原理 简单概述 双脱氧终止反应法,聚合酶延伸链 (由于ddNTP的2'和3'都不含羟基,其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键,因此可以用来中断DNA合 ...
-
Nature 子刊:三代测序的DNA提取和宏基因组学分析
改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取,纳米孔测序和宏基因组学装配 Improved high-molecular-weight DNA extraction, nanopore sequenci ...
-
新手做短视频二次剪辑,0基础入门流程,手把手教会你,手机就行
利用下班后的空闲时间做短视频二次剪辑,不需要你有颜值和才艺也能做,除了工资也能多一份额外收入,抓紧收藏吧. 今天大周给小伙伴们分享一下具体流程: 一.选择平台 大周建议新手小白在刚开始入门操作的时候, ...
-
新手小白做短视频自媒体,入门流程分享,让你少走很多弯路
新手小伙伴们在做短视频自媒体之前一定要有一个规划.计划,要有一定的方法去操作,切记不可漫无目的的开始. 这几个流程需要一步步去操作: 1.变现方式 做短视频之前你要思考你做短视频要通过哪种方式变现:播 ...
-
技术贴 | 宏基因组专题 | 组装工具盘点和比较
本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助.原创微文,欢迎转发转载.导读宏基因组组装工具非常多.如何从众多组装工具中选择适合分析自己的宏基因组测序数据的工具呢?为了解决这个问题,我搜集了宏基因组 ...
-
原创解读 | 三代测序在群体水平上的研究进展
导语: 三代转录组测序技术从兴起到现在,也有些年头了.三代测序基于其测序读长的优势,一方面可直接校正有参基因组序列,另一方面对无参基因组的测序与组装意义重大.2021年5月28日,Nature Rev ...