GeoDiver：GEO数据挖掘分析利器 / 开普饭

Bioinformatics analysis of gene expression profiles of Inclusion body myositis包涵体肌炎基因表达谱的生物信息学分析一.研 ...

前几天和大家介绍了一下GEO数据库以及使用GEO2R进行差异表达分析GEO2R差异表达分析软件.几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析.那么GO和KEGG都是什么?富 ...

万能公式登场 A基因 (RNA/蛋白) ↓ X疾病的B通路 ↓ C功能那么大致的方向有哪些呢??????? 1. A, B和C水平和生存,临床分期等的关系 B/C如果不是单个水平的基因(比如说是某个 ...

An Integrated Network Analysis of mRNA and Gene Expression Profiles in Parkinson's Disease 帕金森病mRNA和 ...

科研资源不同,自然选择就不同.没有科研经费的人会比较喜欢纯生信数据挖掘这种模式:有科研经费的人可能更喜欢生信+实验这种模式.之前纯生信数据挖掘的发文思路已经分享了很多,所以这次我们分享一下GEO数据挖 ...

Identification of Key Genes and Pathways for Enchondromas by Bioinformatics Analysis利用生物信息学分析鉴定内生软骨瘤 ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 功能富集分析在得到了差异基因的基础之上,进一步进行功能富集分析,这里 ...

曾经很多人问过我们,GEO数据挖掘只有一张芯片,还能发文章吗?我们的答案:肯定能.今天就给大家分享一篇只分析了一张芯片的文章,这篇文章2018年8月份发表在BioMed Research Inter ...

为什么说它好发呢?废话不多说,直接上图: 我们看了一个上午发现全部基本是中国人写的meta和GEO数据挖掘类的文章,就三月份出版的就一大堆. 期刊介绍 OncoTargets and Therapy, ...

参考文章:Bioinformatic analysis identifying FGF1 gene as a new prognostic indicator in clear cell Renal ...

大家可能有过讨价还价的经历,你之所以要砍价,是因为觉得商品卖贵了,不值这个价.这里,其实就用到了估值.估值就是评估一项资产的价值,通过比较资产的估值和价格,判断目前的价格是贵还是便宜. 那么基金如何估 ...

关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...

根据circRNA分析软件benchmark文献推荐,KNIFE准确度最高,circRNA分析优先推荐使用KNIFE工具. 参考文献:A comprehensive overview and eval ...

GEO数据挖掘系列文-第一期-胶质母细胞瘤文章标题 lncRNAs PVT1 and HAR1A are prognosis biomarkers and indicate therapy outc ...

In molecular biology, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) is a biol ...

GeoDiver：GEO数据挖掘分析利器