送你一篇TCGA数据挖掘文章 / 开普饭

利用R包DEseq2进行差异表达分析和可视化 count数矩阵差异分析 1. 安装并载入R包 2. count数矩阵导入并对矩阵进行数据处理 3. 查看样本相关性并采用热图展示 4. hclust对 ...

本文为群中小伙伴进行的一次差异分析探索的记录. 前段时间拿到一个RNA-seq测序数据(病人的癌和癌旁样本,共5对)及公司做的差异分析结果(1200+差异基因),公司告知用的是配对样本的DESeq分析 ...

昨天我们提到了两个小鼠器官单细胞图谱 , 里面介绍的2018年其实在nature和cell分布发表了小鼠器官单细胞图谱研究数据,表达矩阵都是可以直接下载的,浙江大学的研究有小白鼠近50种器官组织的4 ...

宠物萌宠秀

有人会说纯生信SCI是"垃圾论文",一直忽略它的研究意义,大多数做纯生信数据挖掘的人都是没有钱做验证的,故没有办法证明某一分子是否促进/抑制肿瘤发生发展,更没有办法探索其具体作用机 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

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感觉好像每隔几年学术界就掀起了一阵批判P值的讨论,正好我这里有个例子,分享给大家. 依然是安排给学徒完成的:菜鸟团(周一数据挖掘专栏)成果展文献是:Cancer Manag Res. 2018 标题 ...

本笔记来源于福建医科大学研究生前些日子,老师给了我一份大纲并让我重启一下机器学习的系列,但是我看完之后发现,可能是由于老师在写大纲的时间比较早,并且也长时间没更新,导致内容略微有些过时,于是我打算用 ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了!2019上海站学员兴高采烈的私聊我说在咱们生信技能树学习班学到的知识马上用起来了,一个单细胞纯生信数据挖掘文章的全部代码小半天就全部弄完了. ...

写给粉丝的话: 以下是正文风吹一片叶,万物已惊秋. --杜牧<早秋客舍>. 今日"立秋",暑去凉来,意味着秋天的开始. 立秋节气一般在8月7-9日之间.今年立秋时间 ...

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