高通量测序如何寻找T-DNA插入的位置 / 开普饭

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

写在前面最近主要忙一些植物群体基因组数据的项目.前面提过,赶时间,全基因组的 SNP Calling 使用 GATK 流程,还是需要跑上两三天.但这个还是耗时,并不一定能够赶上工期.于是我将目标转移 ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

本文目录 UMI简介实验流程生物信息学分析流程(带UMI标签) Trimmomatic或cutadapt过滤 FastQc数据质控 picard进行uBAM转换 fgbio提取UMI信息 samtoo ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

近日,国家卫生健康委临床检验中心(简称NCCL)公布了2021年肿瘤游离DNA基因突变高通量测序检测室间质量评价结果,迈景基因保持一贯高水准的质控水平,以满分成绩通过测评. 肿瘤游离DNA(ctDNA ...

陈按:中国抗癌协会肿瘤靶向治疗专业委员会从结直肠癌NGS检测的临床角度及实验室流程质控角度共同起草了中国专家共识及标准,以指导NGS检测技术在结直肠癌诊疗中的规范应用,帮助临床医师解读报告,为结直肠癌 ...

近日,<临床肿瘤学杂志>发布了2021版<结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识>(以下简称"共识"), 该<共识>由中国抗癌协会靶向治疗专业委 ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国加州大学圣地亚哥分校张鹍教授等人于2019年10月14日在Nature子刊Nature Biotechnology在线发表题为< ...

美国耶鲁大学的研究人员Shantao Li和Mark B. Gerstein,澳大利亚莫纳什健康的研究人员Kay W. Choy于2019年1月10日在<N Engl J Med>上发表对 ...

推荐:江舜尧编译:杉砜编辑:小菌菌北京科技大学王飞教授团队于2020年5月10日在Science ofThe Total Environment上发表了题名为<Integrating hi ...

推荐:江舜尧编译:罗睺编辑:十九北京食品科学研究院王文平教授研究团队于2019年9月21日在Food Microbiology在线发表了题目为<High-throughput sequen ...

本文由Frank编译,十九.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读中国发酵蔬菜的制作传统历史悠久,其中以西北地区的浆水和东北地区的酸菜最具代表性.发酵蔬菜的味道和风味等特点高度依赖发酵过程所生 ...

高通量测序如何寻找T-DNA插入的位置