安装snpEFF工具并对VCF文件进行注释【直播】我的基因组85
相关推荐
-
CPU漏洞详解
CPU漏洞详解
-
从TCGA下载的甲基化数据格式解读
谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...
-
家系分析软件汇总
作者:charon 审稿:童蒙 编辑:amethyst 二代测序技术蓬勃发展,已经用于临床上辅助疾病诊断,利用二代测序数据挖掘孟德尔遗传病相关的基因及变异位点也是越来越普遍.近年来,研究人员开发出很多 ...
-
(7条消息) ubuntu16.04 安装交叉编译工具aarch64
前言 最近需要把人脸识别代码放到RK3399Pro的嵌入式板子上,所以编写好的c++ 代码要放到板子上编译,或者在ubuntu系统上使用交叉编译工具,编译好可执行文件在放到板子里运行.为了在能在ubu ...
-
如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?
需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt image.png test.vcf image.png 代码实现 ...
-
手机免安装0流量扫码传送文件神器实际操作
手机实用技巧传输文件神器,简单实用方便快捷扫码就能传文件免安装!欢迎关注留言讨论!我还会不定期分享更多手机简单实用技巧软件!
-
流氓软件卸载神器147142专业版:免安装!免激活!单文件版!
本软件为舶来品,已全面汉化,界面清爽简洁,纯粹的卸载功能,双击程序就能直接看到电脑上已经安装的程序,直接右键确认下载即可,一些顽固程序也可以通过这款软件进行删除,强力卸载无残留,让您的电脑处于最整洁的 ...
-
开源的 win11 安装检测工具、AI 音频分轨工具、集中管理你的阅读数据 | 今天有什么?
产品皆活物 · 用者无机心 WhyNotWin11 - 开源的 win11 安装检测工具 WhyNotWin11 是一款用于检查你的电脑是否可以满足安装 Windows 11 最低配置要求的开源工 ...
-
【直播】我的基因组 31:vcf文件标记dbSNP的rsID号
vcf文件标记dbSNP的rsID号的这个问题非常多的人问过,大部分的variation calling软件给出的vcf文件里面第3列都是一个纯粹的dot占位符,如下: 但是,我们往往想知道,这个染色 ...
-
【直播】我的基因组81:看看我的vcf文件的vaf分布情况
这一讲中,我们对VCF中的"VAF"简单的来看一起,如果你对VCF文件还不了解的话,那你就要自我批评一下了.在基因组直播刚开始的时候,我还专门对VCF文件进行了简述.[直播]我的基 ...
-
从WGS测序得到的VCF文件里面提取位于外显子区域的【直播】我的基因组84
首先要下载并且得到人类基因组的外显子坐标记录文件 这里我用的参考基因组版本仍然是hg19,所以去CCDS数据库里面下载对应版本,并且格式化成BED文件. wget ftp://ftp.ncbi.nl ...
-
使用GATK合并比较多个vcf文件
这不是简单的坐标合并,多个样本的vcf文件里面都只会记录对应样本的变异位点信息,但是因为样本检测手段不一致,可能是WGS或者WES,或者不会测序,意味着基因组某些区域可能是根本就没有被测序到,也就无从 ...