【直播】我的基因组 31：vcf文件标记dbSNP的rsID号 / 开普饭

来源地址:https://blog.csdn.net/xxxie_/article/details/100111991 欢迎订阅WX众号:基因学苑,更多精彩内容等你发掘! 基因学苑Q群:3279872 ...

作者:charon 审稿:童蒙编辑:amethyst 二代测序技术蓬勃发展,已经用于临床上辅助疾病诊断,利用二代测序数据挖掘孟德尔遗传病相关的基因及变异位点也是越来越普遍.近年来,研究人员开发出很多 ...

这一讲中,我们对VCF中的"VAF"简单的来看一起,如果你对VCF文件还不了解的话,那你就要自我批评一下了.在基因组直播刚开始的时候,我还专门对VCF文件进行了简述.[直播]我的基 ...

首先要下载并且得到人类基因组的外显子坐标记录文件这里我用的参考基因组版本仍然是hg19,所以去CCDS数据库里面下载对应版本,并且格式化成BED文件. wget ftp://ftp.ncbi.nl ...

这个软件比较重要,尤其是对做遗传变异相关研究的,很多人做完了snp-calling后喜欢用ANNOVAR来进行注释,但是那个注释还是相对比较简单,只能得到该突变位点在基因的哪个区域,哪个基因这样的信息 ...

需求客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt image.png test.vcf image.png 代码实现 ...

编译:寒江雪,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读越南人参是具有重要药用价值的特有濒危物种,由于缺乏有效的分子标记,种群的遗传多样性和结构尚不清楚.本研究对越南人参进行基因组和转录 ...

CCTV5直播国乒,31岁战神约战世界第一,许昕状态火爆冲2冠王北京时间5月30日消息,2021国乒奥运模拟赛南阳站进入到最后一天的角逐,将决赛男女单打冠军.男子单打方面,两场半决赛对阵为:樊振东V ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

问题描述这个需求很常见,因为一般生物信息学数据比较大,比如sam,vcf,或者gtf,bed都是把所有染色体综合在一起的文件.如果想根据染色体把大文件拆分成小的文件呢?比如:ftp://ftp.ncb ...

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