批量IGV截图【直播】我的基因组83 / 开普饭

NGS数据分析实践:02. 参考基因组及注释库的下载 - 目录 1. 参考基因组数据 2. 已知的SNP和Indel变异数据 3. annovar注释所需数据库的下载 4. 其他数据库系列文章: 二 ...

[软件介绍]IGV软件的安装和基本介绍 - 目录 1. IGV 下载与安装 2. Java 安装及环境变量设置 3. IGV 基本介绍 3.1 IGV 界面布局 3.2 IGV 结果界面 3.3 序列 ...

命令讲解主要讲解4个内容: 1.弹出对话框 2.创建同级别文件夹 3.页面截图另存为 4.显示消息实战演练 ●课程时长:19分钟 ●难度级别:初级真资格零基础.一学就会.甜美小姐姐倾情讲解. 实 ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

写在前面今天课题组师妹与我提到,其要下载Phytozome上的所有数据.这个事情,我在早在几年前干过.不过前年有整了一次.整体简单,以下附上之前的记录. 2017年的记录稍微整理了流程,方便批量下 ...

下载IGV和导入文件的方法我就不多说了,可以直接在windows平台下使用,就跟你操作QQ一样,自己摸索就好了! 著名芬兰运动员Eero Mäntyranta,他拿过七枚奥运奖牌.他的血红细胞远超正常 ...

前面我们特意用scalpel软件来找indel,期待它会有一些出彩的表现,当然我还没来得及比较它找到的INDEL跟GATK等工具区别在哪里,不过我们先在IGV里面看看找出来的是什么吧. [直播]我的基 ...

目前我使用的仍然是hg19系统的参考基因组,所以就在gencode数据库里面下载了基于hg19的gtf注释文件,并格式化如下: head ~/reference/gtf/gencode/protein ...

批量IGV截图【直播】我的基因组83