对参考基因组按照200k分区间统计测序深度及GC含量 / 开普饭

bedtools是一款非常强大的用于处理bed,vcf,gff等格式数据的工具,该软件由犹他大学的Quinlan实验室开发.但是目前bedtools主要提供的是在linux,unxi等操作系统环境下的 ...

bedtools是区间操作最常用的软件,pybedtools对其进行了封装,可以在python编程环境中灵活使用bedtools,而且进一步拓展出了很多有用的功能. 在pybedtools中, 核心是 ...

使用qualimap对wes的比对bam人家总结测序深度和覆盖度ls -lh *raw.vcf-rwxrwxrwx 1 root root 184M Jun 7 10:58 SRR7696207_ra ...

在前面我们用 ChIP-seq 的分析方法可视化了一下我的 WGS数据,结果我们的测序深度分布居然是跟基因组的genomic feature相关. 比如在TSS附近,就很明显看到了一个测序深度峰值(具 ...

- - - 小勤:怎么样能对订单按销量分区间进行统计啊? 大海:针对销量读取所属区间信息,然后再分组不就可以了吗?如文章< 只是一个简单的分区间问题?No,我要告诉你更通用的表间数据匹配方法!& ...

跟李锐学Excel, 高效工作,快乐生活. 1个公式将数据按类别分区间统计工作中会遇到分类统计以及按区间统计等问题,很多人一旦遇到这类问题就头晕脑胀眼发花,其实掌握一点函数技巧只需1个公式就可以搞定 ...

看来本次直播我的基因组分析流程效果还不错,不少朋友跟着自己动手开始分析全基因组测试数据了,值得表扬.其中有好几个朋友留言向我反映公司给的统计报告里面的覆盖度的问题,如下图: 我在第 8讲中写道,每条染 ...

来源:光明网-<光明日报>2021-05-09 02:31 X 我科学家绘制出高精度亚洲猪参考基因组图谱有助于新品种培育改良光明日报北京5月8日电记者杨舒8日从中国农业科学院获悉,该 ...

前言 EXCEL中统计函数是比较常用的函数,经常用到的如COUNT,COUNTA,COUNTBLANK,COUNTIF,COUNTIFS,SUMPRODUCT等等都可以进行数据统计,原来COUNT也是 ...

小勤:用RELATED或LOOKUPVALUE函数都是精确匹配,但,有时候我想实现分区间的操作,怎么办?类似LOOKUP函数(或VLOOKUP函数的模糊匹配)功能,比如说有价格区间如下图所示: 怎么用 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读蛇咬毒害是一种严重而被忽视的热带病,每年造成约10万人死亡.对毒素基因进行高质量基因组的全面表征将有助于开发有效的人源化重组抗蛇毒血清 ...

对参考基因组按照200k分区间统计测序深度及GC含量