【直播】我的基因组67：clinvar数据库 / 开普饭

写在前面越来越多的研究发现某一个基因的突变和很多的临床特征有关系.如果我们想有查找临床性状和基因突变的关系的话,内容比较全面的就是ClinVar数据库了.ClinVar 数据库是ncbi旗下用于查看 ...

编译:MUSHROOM,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读瘤胃具有特殊的功能,能消化分解植物饲料中复杂的多糖.瘤胃微生物基因组编码可以消化反刍动物日粮中的植物的各种酶类.本研究采 ...

前面我们说到了那些简单的由单个基因决定的性状,这东西不需要预测,其中的生物学机制已经研究的非常透彻,只要拿到你的基因信息,很容易推断你的性状,比如人的乙醇脱氢酶和乙醛脱氢酶等多种乙醇代谢基因,你本身是 ...

在很久以前的我直播基因组活动,我提到过这个数据库: [直播]我的基因组67:clinvar数据库不过,那个时候遗传背景知识不够,其实并没有很好的理解它,现在有机会重新学习一下,可以使用以下代码下载并 ...

最近的全国巡讲不少人问到我两年前的直播基因组系列教程的完整目录,这里先放出直播我的基因组(第一阶段)完整目录.(悄悄告诉你,后台回复直播可以拿到精排版EXCEL表格!)(然后,点击阅读原文也可以拿到可 ...

遗传变异的数据库注释非常简单,就是从数据库里面下载记录文件,然后根据坐标对应一下即可,甚至很多成熟的工具都可以自动下载数据库以及比对,就跟我们前面讲到的把vcf文件注释到dbSNP数据库的ID一样简单 ...

之前在一篇NC的文献(如何利用公共数据发NC)当中,提到过一个公开的测序数据(MSK-IMPACT).所以今天就来简单的介绍一下这个数据集.这样,在进行公共数据挖掘的时候,除了TCGA.同时也可以考虑 ...

前段时间我们在对 [[CCLE-肿瘤细胞系百科全书 v2.0-数据下载]] 新的使用方式进行了系统的讲解.其中提到了 [[DepMap Portal-肿瘤细胞系综合分析数据库]] 这个工具.在这个工具 ...

前段时间一个汇总了多个基因组 CRISPR 数据的数据库:[[BioGRID ORCS-CRISPR筛选数据库]].同时之前也介绍了一个肿瘤细胞系相关的 CRISPR 数据库 [[DepMap Por ...

大家好,又是一周不见. 这次见面,已然是一个悲伤而又狂欢的日子,这个双十一,小编从一只单身汪已经变成了断手单身汪,累觉不爱.但是,扶朕起来,朕还能学. Jimmy的测序数据终于出来了,虽然还没寄到Ji ...

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