基于两种不同算法的可变剪切数据库 / 开普饭

引言前面两期主要为各位简单介绍了转录组测序以及转录组测序的方法,相信各位对转录组测序有了一定的了解.那么测序后进行数据分析,具体包含哪些分析内容呢?本文就详细为各位介绍一下. 分析内容 mRNA是具 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年7月12日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:expDataTPM > ##加载数据,数据对象是一个数据 ...

MA Anderson御用软件SpliceSeq已经是发表于2012的文章了:<SpliceSeq: a resource for analysis and visualization of R ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

最近接到粉丝求助,他看到了一个很简单的肿瘤单基因数据挖掘文章:A TP53-associated gene signature for prediction of prognosis and ther ...

ML之kNN(两种):基于两种kNN(平均回归.加权回归)对Boston(波士顿房价)数据集(506,13+1)进行价格回归预测并对比各自性能输出结果 Boston House Prices dat ...

ML之回归预测:利用两种机器学习算法(LiR,XGBoost(调优+重要性可视化+特征选择模型))对无人驾驶汽车系统参数(2017年的data,18+2)进行回归预测值VS真实值输出结果 1.LiR ...

深度学习 Author:louwill Machine Learning Lab 最近问部署的读者比较多,分享一篇去年写入门级总结. 本文对深度学习两种模型部署方式进行总结和梳理.一种是基于web服务 ...

文/月下客我用了挺长时间去思考,为什么我--一个理科生妈妈,养出了一个文科生月宝? 从小到大,在数理化领域一路畅行的我,近期被小学数学难住了. 就像一个天生筋骨柔软的人,后脚跟一下能扳到后脑勺,但是 ...

在生物体进化过程中,基因组及其包含的基因是不断变化的.在包括小麦在内的许多作物中,多倍体事件不仅导致了显著的基因组变化,并且在植物进化过程中也不断发生.小麦作为全球最重要的主食之一,用于粮食生产的主要 ...

基于fastq测序数据可以做可变剪切,比如bioconductor流程rnaseqDTU 就说明了salmon软件和R包打配合,不过大多数情况下,我们其实已经采用了star或者hisat2软件对fas ...

rMATS这款差异可变剪切分析软件的使用体验用LeafCutter探索转录组数据的可变剪切用Expedition来分析单细胞转录组数据的可变剪切使用SGSeq探索可变剪切用DEXSeq分析可变 ...

前些天我在生信技能树介绍过star-fusion:最好用的融合基因查找工具终于正式发表了 ,然后在另外一个教程:一个好像没有做任何改变的参数提到了目前大量的单细胞转录组数据出来了,却没有一个文章去探 ...

基于两种不同算法的可变剪切数据库