GEO数据库可能遇到的问题 (二) / 开普饭

这篇文章题目:ZNF154 is a promising diagnosis biomarker and predicts biochemical recurrence in prostate can ...

最近在整理表观相关技术文献,包括各种甲基化芯片技术,27k,450k,850k,以及甲基化测序的 WGBS和RRBS其实它们应用,最后也是构建各种模型,比如分子分型啊,细胞比例他推断啊,分类模型或者预 ...

昨天介绍完GEO2R之后其实该和大家说一下富集分析相关的东西了(昨日链接:GEO2R差异表达分析软件).但是,由于GEO数据库里面的数据种类比较多,所以经常我们用的这个数据集和其他数据集有区别,所以就 ...

没有样本,没钱测序,如何拿别人的数据来发自己的文章呢? 公共数据库挖掘呀! 众所周知,TCGA和GEO是最著名的两大公共数据库,前者主要存储高通量(二代测序)数据的肿瘤样本数据(TCGA的0代码可视化 ...

GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库.它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就 ...

在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律,也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库,当然,我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析过它,欢迎大家自行搜索学习.总得来说,从 ...

耗费半年的时间精心制作了成套的生物信息学入门视频教程,并且在生信技能树联盟平台发布了这个长达74个小时全套生物信息学入门视频:生信技能树视频课程学习路径,这么好的视频还免费! 在B站看了看,大家学的热 ...

接收到太多的粉丝求助,想下载个表达矩阵做一下数据挖掘偏偏第一步就卡在了,数据文件下载半天毫无动静,或者下载到99%就卡死了.如果我恰好在电脑旁,通常会帮忙下载后微云或者百度云传递给粉丝,但这毕竟不是长 ...

最近还是大量粉丝留言表示自己因为疫情困在家里,想做数据挖掘混个本科毕业论文,但是看完我的GEO数据挖掘视频后,想下载个数据集,就被卡死了,实在是巧妇难为无米之炊! 这个不怪大家,我给大家的免费的GEO ...

最近在读AUCell包的文档,链接是:http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/AUCell.html,这个包的教程我已经写完了, 在 :使 ...

师兄的文章要送审,编辑让把RNA-seq的数据传到GEO数据库上,今天就在传这个数据. 之前没传过数据,今天就是一边学一边搞这个. 一.注册账号先注册一个GEO账号二.准备工作选择Data ty ...

GEO数据库可能遇到的问题 (二)