TCGA数据分析总结（截止2020.4.21）

子曰：温故而知新，可以为师矣。

曾子曰：吾日三省吾身——为人谋而不忠乎？与朋友交而不信乎？传不习乎？

截止到目前，TCGA得常规操作应该都有介绍过了。总结来说有一下几个方面

1 TCGA在线数据库

TCGA数据分析系列（一）

TCGA数据分析系列（二）：数据库之GEPIA2

TCGA数据分析系列（二）：UALCAN数据库

TCGA数据分析系列（二）：LinkedOmics

2 TCGA数据下载

TCGA数据下载与ID转换

3 差异分析，火山图热图绘制

TCGA差异分析及ggplot作图验证

TCGA数据分析系列之火山图

R语言学习系列之“多变的热图”

4 差异分析后的常规操作

TCGA数据分析系列：蛋白相互作用网络

TCGA数据分析系列：零代码富集分析：ClueGO+CluePedia（1）

5 TCGA泛癌，单基因差异表达，分期表达，生存分析等

TCGA任意基因任意肿瘤，随意分析（mRNA）

TCGA任意基因任意肿瘤，随意分析(2)（lncRNA）

R绘图：雷达图-单基因泛癌差异表达的另类展现形式

做泛癌时，20多个差异基因集需要取交集怎么办

麻雀虽小，五脏俱全。