转录组学习二（数据下载） / 开普饭

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

同样的GEO数据库的NGS数据重新处理,按照往常的方式下载sra转为fq,链接是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10233 ...

距离公布要带500个优秀本科生入门生物信息学的活动不到一个月,虽然真正入选不到一百,但是培养成绩喜人,出勤率接近百分之百,大部分人在短短两个星期就完成了R基础知识学习,Linux认知,甚至看完了转录组 ...

但很多粉丝留言表示这些英文教程看不懂,数据也很分散,没有中文解说实在是很难跟下来,希望我们出一个手把手系列教程. 这个全套 MeRIP-seq 图表复现代码在GitHub:https://github ...

学完了生信技能树的转录组课程,是时候实战一波了,我选择的是 NCBI数据集是SRP033333 Description KPC (Comparing mutant-p53 expressing cel ...

[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! 下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProj ...

当我们需要一些NGS数据时,一般会去NCBI或者EBI的数据库中下载.但是当我们用wget下载时,时常会出现断开连接或者网络下载速度缓慢,对于几十G或者上百G的数据,下载无计可施,这是则可以使用Asp ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

对原始测序fq文件数据进行质量控制任务了解fastq测序数据需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量! 作业,理解测 ...

更多技术干货第一时间送达作者|Memory逆光本文由作者授权分享导读脑电图(EEG)是一个复杂的信号,一个医生可能需要几年的训练并利用先进的信号处理和特征提取方法,才能正确解释其含义.而如今机 ...

前言交代 1.学习参考之前参加了生信技能树花花老师的TCGA数据挖掘试讲课,收获很多,最近整理一下上课笔记,同时参考了老师的简书相关教程.生信入门的朋友也可微信加入生信星球公众号,个人觉得很好的一个 ...

key 操作删除 key:del key 批量删除key:redis-cli -a(密码)keys "QXJ_*"| xargs redis-cli -a(密码)del 查看所有 ...

前面说了主从复制的原理,现在我们搭建主从结构 1. 提前准备我准备了两台主机,主节点是远程的centos7,从节点是本机windows 主从复制的原理在上一篇已经说了:主节点中mysql创建一个用户 ...

二.地天人三元龙在玄空风水学上,我们将地盘正针二十四山分成地.天.人(三才)三元龙.周天八个卦宫中任何一个卦宫均有三个山,按顺时针方向,依次排列的元龙顺序是:地元龙.天元龙.人元龙. 在这里买翡翠不 ...

魏晋是书法走向艺术自觉的重要转变时期.作为书体演进的一个环节和这一时期众多书家的突出代表,王羲之兼工诸体,并继往开来,裁成不同于汉魏的草.行.楷新体(今体):王献之书承羲之,交融草.行而宏逸过父.二王 ...

魏晋是书法走向艺术自觉的重要转变时期.作为书体演进的一个环节和这一时期众多书家的突出代表,王羲之兼工诸体,并继往开来,裁成不同于汉魏的草.行.楷新体(今体):王献之书承羲之,交融草.行而宏逸过父. 二 ...

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