首次揭秘！不做实验也能发10 SCI，CNS级别空间转录组套路全解析（附超详细代码！） / 开普饭

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 回顾 Seurat新版教程:分析空间转录组数据(上 ...

Single-cell RNA sequencing of human kidney 人肾脏的单细胞测序一. 研究背景肾脏是在结构和功能高度复杂的器官,而其结构和功能的复杂性与其众多的细胞类型相关 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. Giotto|| 空间表达数据分析工具箱 ...

Seurat4.0系列教程告一段落,但这决不是终点.这个系列教程只是给大家打开一扇窗,知道Seurat4.0有这些功能可用,少走弯路,起到一个抛砖引玉的作用,后续还要自己深入研究.不要像我当初入门单细 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 1思考题: 2 3+ 如何将空间数据与表达数据关联 ...

实体瘤肿瘤特异性免疫预后特征及其与免疫检查点治疗的关系首先让我们通过摘要了解下这篇文章的主要内容,为了阐明免疫细胞浸润作为实体肿瘤预后标志的作用,作者分析了四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和TC ...

Benchmarking principal component analysis for large-scale single-cell RNA-sequencing大规模单细胞RNA测序的基准主成 ...

文章信息文献标题:The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq 发表时间:2020.06.21 发表杂志:N ...

CSC – IT科学中心是芬兰国家和高等教育机构拥有的芬兰信息技术专业中心.为高等教育机构,研究机构,文化,公共管理和企业提供国际优质的ICT专家服务,以帮助客户蓬勃发展并造福整个社会. 每年,他们都 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读骨髓是血液生成和骨骼再生的主要部位.但是,其细胞和空间组织定位仍存在争议.本研究结合单细胞和空间转录组学系统地揭示了不同骨髓生态位的分 ...

加载数据能够同时检测来自同一细胞的多种数据类型,称为多模式分析,代表了单细胞基因组学的一个新的和令人兴奋的前沿.例如CITE-seq能够同时检测来自同一细胞的转录组和细胞表面蛋白质.其他令人兴奋的技 ...

今天跟大家分享的是2020年02月24日发表在International Journal of Oral Science (IF=2.75)杂志上的文章High expression of ACE2 ...

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics 联合单细胞转录组 ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

单细胞转录学改变了我们描述细胞状态的能力,但深入的生物学解释需要的不仅仅是分群.随着测量不同细胞模式的新方法的出现,一个关键的分析挑战是整合这些数据集,以更好地了解细胞身份和功能.例如,用户可以在同一 ...

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