R数据分析：如何用层次聚类分析做“症状群”，实例操练 / 开普饭

对应原版教程第10章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html "物以类聚,人以群分" 分群步骤即将基因表达( ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=16881 灰色关联分析包括两个重要功能. 第一项功能:灰色关联度,与correlation系数相似,如果要评估某些单位,在使用此功能之前转置数据.第 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22838 本练习问题包括:使用R中的鸢尾花数据集 (a)部分:k-means聚类使用k-means聚类法将数据集聚成2组. 画一个图来显示聚类的 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=2981 聚类分析算法很多,比较经典的有k-means和层次聚类法. k-means聚类分析算法 k-means的k就是最终聚集的簇数,这个要你事先自 ...

导读 2011年,肠型(Enterotypes)的概念首次在<自然>杂志上由Arumugam等[1]提出,该研究发现可以将人类肠道微生物组分成稳定的3种类型,因为这3种类型不受年龄.性别. ...

为什么要转化聚类结构和树结构呢? 因为通过聚类,通过矩阵计算出来的树和基于进化距离做的树结构其实是相似的,借助于ggtree也好还是其他可用于树结构可视化的分析也罢,都可以进行很好的展示,所以在这里我 ...

大家好,我是风.欢迎来到风风的从零开始单细胞系列.前面我们已经学习了数据下载.构建分析对象和数据质控.如果你的scater出现了一些警告内容,提示函数被替代,那也不用着急.正如其他内容一样,scate ...

文章的题目是A bidirectional Mendelian randomization study supports causal effects of kidney function on bl ...

发现大家做分析做的最多的还是线性回归,很多人咨询的都是线性回归的问题,今天专门出一个线性回归的文章. 在R语言中我们可以非常方便地用基础包中的lm方法做出线性回归.参数的书写也和数学方程一样一样的Y~ ...

今天给大家写写生存分析: Survival analysis corresponds to a set of statistical approaches used to investigate th ...

看似小小的中介,废了我好多脑细胞,这个东西真的不简单,从7月份有人问我,我多重中介,到现在的纵向数据中介,从一般的回归做法,到结构方程框架下的路径分析法,到反事实框架做法,从中介变量和因变量到是连续变 ...

做结构方程的时候分组比较用的比较多,咨询的同学也多,之前写过mplus的做法,今天就再给大家写个用R的,不论你是做中介还是做验证性因子分析,等等,反正用结构方程能做的都可以套这个方法,而且在R语言的l ...

今天给大家写一个非常经典的结构方程模型的例子,这个例子是用来研究精神错乱的,模型总共有3个因子,一个社会经济地位SES,另外两个分别是1967年和1971年的精神错乱alien.每个因子两个测量指标, ...

好久没有更新文章了,因为同学们咨询的问题有点多,另一个原因就是自己实在太懒.... 今天继续给大家写广义估计方程式GEE. In statistics, a generalized estimatin ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22206 模型背景每一个动态现象都可以用一个潜过程(Λ(t)来描述,这个潜过程在连续的时间t内演化.当对重复测量的标志变量进行建模时,我们通常不会 ...

今天收到了北京大学老师打来的电话,问我如果没有被数据科学方向的导师录取,愿不愿意去读生物统计的博士. 我婉拒了,些许遗憾,但不后悔,原因全是个人选择,读博挺好的,但是我决定换一种环境,去工作了. 从去 ...

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