热图在单细胞数据分析中的应用 / 开普饭

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较.可以添加多种图展信息,如热图.散点图等. 本文目标: 可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮.可 ...

使用 XENA下载的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图. 一基因词云有小伙伴在https://mp.weixin.qq.com/s/DvX_pKPF9b ...

Hello,各位小伙伴们,我们是科研菌!! "科研菌"团队每天为您提供高质量的原创科研论文精读, 期刊投稿, 资源分享和文章:每天一篇文章深度剖析,给您更开阔的科研思路只需长按识 ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

ComplexHeatmap可以绘制很复杂的热图,能满足日常以及文章所需,本次先简单的介绍单个热图绘制的内容. 单个热图由热图主体和热图组件组成.其中主体可分为行和列:组件可以是标题.树状图.矩阵名称 ...

前面我们提到过broad开发了工具来对单细胞转录组数据计算CNV及绘制热图,因为这个方法学本来就是他们建立起来的. 单细胞转录组数据分析CNV 使用broad出品的inferCNV来对单细胞转录组数据 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 什么是桑基图桑基图(Sankey diagram ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 面向单细胞的技术革命,让我们得以进入新的研究层面, ...

我们这次直接拿GSE118390上已经normalized 的数据进行下游分析.首先我们先看看文献的这张复杂热图,哈哈,这张热图画得真是好看.左边是不同的markers基因对应的细胞类型,上边是6个T ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=18879 这是一个六边形热图可视化程序,主要用到的知识RColorBrewer,fields,也就是R中的可视化绘图库. 本文希望SOM的结果以六边 ...

我们通常听到的一个问题是"什么可以用于分析的数据源?" 在本文中,我们将列出HR和更广泛业务中的许多常见数据源,这些数据源将有助于您进行人员分析. HR数据源可以分为3类: 一.H ...

诸葛君说:产品/运营们最痛苦的莫过于说服开发部门同意我们的网页改版方案,他们往往会充满怀疑的反问:为什么要这样做?总之,在你无法证明"你是对的"情况下,所有的沟通仿佛都站不住脚,今 ...

在<基础技术 | 使用条件格式创建热图>中,我们介绍了使用条件格式的色阶功能创建具有三种不同背景颜色的热图,使数据可视化.在此基础上,结合表单控件滚动条,创建了随滚动条变化的动态热图. 下 ...

热图在单细胞数据分析中的应用