表达矩阵处理—表达质量的控制 / 开普饭

切除修复交叉互补组6基因(ERCC6),又名科科凯恩氏综合症B基因(Cockayne syndrome B,CSB).该基因编码一种DNA剪切修复蛋白,具有ATP刺激的ATPase活性,与几种转录和切 ...

衰老是一种自然过程,随着年龄的增长所有的人都会慢慢衰老,似乎是无法改变的自然规律.但是近年来,随着全球老龄化的加速,世界各国纷纷掀起了一股抗衰老研究的热潮,各种抗衰老药物和疗法也相继被发掘,例如烟酰胺 ...

走过路过不要错过小细胞肺癌(SCLC) 是肺癌的一种特殊类型,与非小细胞肺癌相比,SCLC 具有恶性程度高.侵袭性强.易发生转移的特点.尽管临床试验已评估多种化疗方案的疗效,一些化疗药物在肺癌治疗市 ...

科凯恩氏综合症是早衰症的一种,首次由英国医生科凯恩博士(Edward Alfred Cockayne)于1936年报道. 患儿出生时正常,两岁后发病,典型症状包括面容苍老.头小.眼球内陷.身材矮小.手 ...

书籍翻译好的书籍是人类进步的阶梯,但有些人却找不到优秀的阶梯,为此我们开设了书籍翻译这个栏目,作为你学习之路的指路明灯:分享国内外优秀书籍,弘扬分享精神,做一个知识的传播者. 希望大家能有所收获! ...

貌代码被折叠了,大家需要阅读原文才能复制粘贴我代码在Rstudio里面直接运行,几分钟就可以学会15个图的制作! basic visualization for expression matrix j ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! SRA->FASTQ->BAM->COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每 ...

在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律,也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库,当然,我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析过它,欢迎大家自行搜索学习.总得来说,从 ...

发表这个算法的文章是:Clinical drug response can be predicted using baseline gene expression levels and in vitr ...

最近生信技能树的很多朋友反馈一个GEOquery的bug,而且这个错误对初学者来说,是不可能解决的问题,值得分享一下!(2018-11-27 计) 就是昨天推文末尾的小测试: GEOquery包的ge ...

事情起源于,某个吃了很多汉堡王一起学习的日子,技能树一众学徒一起学习从GEO数据挖掘到limma差异分析等等等. 选的数据集倒是很有.趣.依据原始表达矩阵随便画的热图是这样的

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述)给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战,所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期: RNA-seq的counts值,RPM, RP ...

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述)给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战: 所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期:表达矩阵的归一化和标准化,去除极端值,异常值 ...

表达矩阵处理—表达质量的控制