TCGA数据下载方式小结 / 开普饭

前言交代 1.学习参考之前参加了生信技能树花花老师的TCGA数据挖掘试讲课,收获很多,最近整理一下上课笔记,同时参考了老师的简书相关教程.生信入门的朋友也可微信加入生信星球公众号,个人觉得很好的一个 ...

原创 Sir 老王 Python 集中营 1周前在完成了前面系列的数据整理.数据清洗.数据提取与筛选之后,我们需要对进行进一步的汇总与统计使数据变成我们的可用信息. 1,数据分类汇总 # 对指定列分 ...

这是实战TCGA数据库的又一个知识点,如果你已经对TCGA有浅显的认识,那么我们应该根据研究方向找到自己的癌症类型,TCGA有一台完整的癌症分型,慢慢这个分型也成为了主流,你别不服气,如果我们有这样的 ...

不知道为什么总是有人问我TCGA数据下载这么简单的问题,这问题简单到如何下载人类的hg19.fa这个参考基因组一下,就是http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenpat ...

TCGA是目前使用最多的肿瘤组学数据库,虽然群主已经录制TCGA系列视频教程: 悄咪咪的上线了TCGA知识图谱视频教程(B站和YouTube直达) 里面也提到了各种下载工具,但是作为学徒的我,学习过后 ...

各位科研芝士的朋友,大家好,今天我们继续分享关于TCGA数据下载的专题,之前给大家推出了四个推文,全部是无代码进行数据下载,如果我们想进一步提升自己的水平,那我们从今天开始,开启R语言编程下载TCGA ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列 TCGA数据分析系列 GEO数据分析系列 "老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系 ...

2020年12月18日,由中国信息通信研究院(以下简称"中国信通院").中国通信标准化协会大数据技术标准推进委员会主办的"2020数据资产管理大会"在京召开. ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

各位朋友,大家好,今天我们继续分享关于TCGA数据下载的专题,之前给大家推出了四个推文,全部是无代码进行数据下载,如果我们想进一步提升自己的水平,那我们从今天开始,开启R语言编程下载TCGA数据教程推 ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事. TCGAbiolinks数据下载TCGA数据下载TCGA数据的方法有很多,但比较好用的包我认为就是TCGAbiolinks,T ...

TCGA数据下载方式小结