高通量数据下载还能这样操作? / 开普饭

A 什么是GEO数据库? GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库.它创建于2000年,收录了世 ...

大概一年前,我曾经希望使用"微信圈子"(估计是微信的两大流量转化方式 - 微信小商店和微信圈子之一)来承担 TBtools 用户社群的交流作用,更或者作为个人记录和分享一些碎 ...

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

当我们需要一些NGS数据时,一般会去NCBI或者EBI的数据库中下载.但是当我们用wget下载时,时常会出现断开连接或者网络下载速度缓慢,对于几十G或者上百G的数据,下载无计可施,这是则可以使用Asp ...

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

本期和大家分享糯米饭在使用SRA Toolkit下载NCBI-SRA原始数据的一些Tips,时间宝贵,直接上干货. 1.明确Project:SRP119720,打开浏览器,输入: https://w ...

如何高效又简单地省时地获得SRA公共数据的Fastq格式数据陈胖子下载NCBI SRA数据库上的公共数据,整体上还是大部分搞数据分析,又想灌水的人必做的一个事情. 其实直接使用官网推荐的工具asp ...

[数据库]SRA数据库介绍及数据下载 - 目录 1. SRA数据库介绍 (1) SRP开头的ID:PRJNA = SRP (2) PRJNA开头的ID:SAMN = SRS (3) SRX开头的ID ...

今天在这不介绍微生物区系 Microbiota(土壤的,人体的-)重要性的背景了,因为我们知道她太重要了.我们直接开门见山来介绍USEARCH pipeline (http://www.drive5. ...

导读高通量16S测序经济实惠.周期短,是许多微生物组学尤其是环境微生态方向科研工作者的有力武器. 课题组经费不够,测了16S只能自己分析(省钱啊!!).这里为需要自己处理16S数据的同学,整理了 ...

写在前面伴随高通量测序技术的普及,海量的测序数据被产生并上传到网络数据库,如NCBI SRA.我们每个人都可以很轻易地获得这些数据,并用于有生物学问题针对性地分析.数据容易获取,但数据具体来源和信息 ...

在制作演示幻灯片的过程中,我们经常需要给数据做一个展示,那么我们一般都会通过什么方式对数据进行展示呢? 使用表格归纳数据?使用柱状图.扇形图.直线图等可视化图文表达? 在PPT中直接插入的表格样式,太 ...

今天我们来学习R语言DESeq2做差异分析,第一次我推送这个差异分析到现在已经过去一年多了,我重新排版,更加了一些感悟,重新推送给大家. 基于高通量测序数据的差异分析,为了矫正测序平台,批次,深度等差 ...

下载地址: http://pan.baidu.com/s/1D7ZrC 或直接点击左下角:阅读原文冯承素(617-672),字万寿,长安信都(今陕西西安)人.唐代书法家.贞观(627-649)时任内 ...

导读近日,<临床肿瘤学杂志>发布了2021版<结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识>(以下简称"共识"), 该共识由中国抗癌协会靶向治疗专业委员会发起, ...

成毅绝对算得上男同胞中身材占据优势的佼佼者,181cm的身高能够轻松撑得起各种夸张元素,再有颜值和肌肉的加持更让他穿衣倍有型,恐怕可与男模媲美! 不过成毅却很少选择造型独特且让人难以驾驭的元素,日常搭 ...

高通量数据下载还能这样操作?